More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2375 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  58.37 
 
 
517 aa  654    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  61.14 
 
 
517 aa  673    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  61.22 
 
 
508 aa  678    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  58.75 
 
 
513 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  60.16 
 
 
514 aa  653    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  61.89 
 
 
512 aa  678    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  68.11 
 
 
510 aa  740    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  62.08 
 
 
512 aa  680    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  62.08 
 
 
515 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  62.08 
 
 
515 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  62.08 
 
 
515 aa  680    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  61.89 
 
 
515 aa  678    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  60.2 
 
 
516 aa  668    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  61.37 
 
 
511 aa  670    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  62.08 
 
 
512 aa  680    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  62.48 
 
 
512 aa  684    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  57.14 
 
 
540 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  62.08 
 
 
512 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.4 
 
 
510 aa  685    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  60.36 
 
 
511 aa  646    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  64.64 
 
 
511 aa  700    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  62.08 
 
 
512 aa  681    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  67.64 
 
 
513 aa  736    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  67.85 
 
 
516 aa  733    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  61.67 
 
 
534 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  61.46 
 
 
556 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  57.99 
 
 
507 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  62.48 
 
 
512 aa  685    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  59.14 
 
 
513 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  62.08 
 
 
511 aa  693    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  61.22 
 
 
509 aa  669    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  73.87 
 
 
510 aa  796    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  59.26 
 
 
533 aa  656    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  61.07 
 
 
506 aa  652    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  100 
 
 
513 aa  1056    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  63.19 
 
 
509 aa  701    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  62.99 
 
 
509 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  56.64 
 
 
560 aa  634    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  59.14 
 
 
513 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  62.6 
 
 
510 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  60.27 
 
 
516 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  59.65 
 
 
517 aa  660    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  57.67 
 
 
520 aa  643    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  62.8 
 
 
510 aa  660    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  61.1 
 
 
512 aa  680    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  60.2 
 
 
516 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  64.37 
 
 
510 aa  703    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  64.64 
 
 
512 aa  706    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.73 
 
 
510 aa  697    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  56.84 
 
 
533 aa  634  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  57 
 
 
520 aa  634  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  59.85 
 
 
517 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  57.67 
 
 
537 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  57.12 
 
 
560 aa  633  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  59.26 
 
 
514 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  59.26 
 
 
514 aa  630  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  55.71 
 
 
542 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  56.09 
 
 
575 aa  627  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  55.71 
 
 
542 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  57.34 
 
 
518 aa  625  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  55.51 
 
 
542 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  57.89 
 
 
518 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  55.32 
 
 
575 aa  622  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  55.75 
 
 
513 aa  621  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  57.2 
 
 
517 aa  619  1e-176  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  56.95 
 
 
528 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  56.76 
 
 
528 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  55.13 
 
 
540 aa  615  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  58.25 
 
 
525 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  58.49 
 
 
527 aa  616  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  57.25 
 
 
526 aa  617  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  57.48 
 
 
523 aa  613  9.999999999999999e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  58.63 
 
 
516 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  57.83 
 
 
528 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  58.32 
 
 
517 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  56.37 
 
 
528 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  57.09 
 
 
528 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  57.28 
 
 
520 aa  609  1e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  57.28 
 
 
515 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  57.09 
 
 
520 aa  605  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.48 
 
 
526 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  56.89 
 
 
528 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  57.2 
 
 
518 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  57 
 
 
518 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  54.42 
 
 
509 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  57.86 
 
 
533 aa  605  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  57.93 
 
 
517 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  56.5 
 
 
528 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  57 
 
 
518 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  57.78 
 
 
526 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  57.48 
 
 
515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  55.92 
 
 
528 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  56.73 
 
 
525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  55.53 
 
 
528 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  55.34 
 
 
528 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  57.09 
 
 
520 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  58.61 
 
 
523 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  57.86 
 
 
541 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  56.98 
 
 
527 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  57.45 
 
 
514 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>