More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0638 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  69.34 
 
 
511 aa  752    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  75.93 
 
 
511 aa  815    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  100 
 
 
511 aa  1051    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  75.15 
 
 
511 aa  813    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  63.76 
 
 
516 aa  682    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  75.15 
 
 
511 aa  808    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  76.82 
 
 
510 aa  802    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  74.56 
 
 
511 aa  802    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  78.28 
 
 
510 aa  831    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  78.78 
 
 
510 aa  827    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  58.97 
 
 
511 aa  630  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  56.89 
 
 
518 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  57.09 
 
 
513 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  55.69 
 
 
512 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.99 
 
 
512 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  55.19 
 
 
510 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  55.49 
 
 
512 aa  593  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  57.56 
 
 
513 aa  593  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  55.1 
 
 
512 aa  591  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.82 
 
 
514 aa  592  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  54.9 
 
 
512 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.9 
 
 
512 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  54.71 
 
 
515 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  54.71 
 
 
515 aa  588  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  55.66 
 
 
516 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  54.71 
 
 
515 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  55.29 
 
 
512 aa  585  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.71 
 
 
512 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.9 
 
 
515 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  55.23 
 
 
517 aa  586  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  53.36 
 
 
513 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  57.48 
 
 
510 aa  588  1e-166  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  54.71 
 
 
512 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  54.4 
 
 
510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  53.62 
 
 
518 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  55.92 
 
 
513 aa  580  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  55.95 
 
 
511 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  55.36 
 
 
514 aa  578  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  54.24 
 
 
517 aa  580  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  53.16 
 
 
509 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  55.53 
 
 
513 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  54.35 
 
 
513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  54.35 
 
 
513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  52.96 
 
 
516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.3 
 
 
511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  55.4 
 
 
515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  52.96 
 
 
509 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  53.71 
 
 
517 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  53.49 
 
 
526 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  52.92 
 
 
537 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  53.95 
 
 
513 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  54.42 
 
 
515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  53.52 
 
 
516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  53.71 
 
 
516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  53.5 
 
 
575 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  53.5 
 
 
513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  52.57 
 
 
513 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  52.7 
 
 
533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  54.3 
 
 
513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  54.65 
 
 
514 aa  571  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  52.99 
 
 
520 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  54.21 
 
 
526 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  53.88 
 
 
518 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  53.68 
 
 
518 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  52.57 
 
 
506 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  51.58 
 
 
513 aa  568  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  53.44 
 
 
520 aa  570  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  53.63 
 
 
520 aa  565  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  54.46 
 
 
518 aa  568  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  53.59 
 
 
530 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  53.88 
 
 
524 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  53.29 
 
 
520 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  54.9 
 
 
525 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  53.11 
 
 
516 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  54.26 
 
 
518 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  52.85 
 
 
542 aa  565  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  53.1 
 
 
520 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  52.57 
 
 
509 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.32 
 
 
510 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  54.3 
 
 
517 aa  565  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  52.25 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  52.13 
 
 
524 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  50.58 
 
 
542 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  52.99 
 
 
522 aa  558  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  54.94 
 
 
507 aa  560  1e-158  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  52.33 
 
 
526 aa  561  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  51.04 
 
 
575 aa  559  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  52.4 
 
 
525 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  52.36 
 
 
509 aa  557  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  51.44 
 
 
521 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1032  GMP synthase  52.52 
 
 
525 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  53.24 
 
 
511 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  50.19 
 
 
540 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  50.78 
 
 
542 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  52.44 
 
 
525 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1072  GMP synthase  52.52 
 
 
525 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  52.52 
 
 
525 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  52.61 
 
 
525 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  52.71 
 
 
525 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  51.56 
 
 
540 aa  556  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>