More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2880 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  73.24 
 
 
548 aa  813    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  76.28 
 
 
528 aa  847    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  71.07 
 
 
528 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  78.29 
 
 
540 aa  899    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  73.59 
 
 
528 aa  800    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.45 
 
 
517 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  100 
 
 
542 aa  1118    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  73.79 
 
 
528 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  72.23 
 
 
528 aa  792    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  81.35 
 
 
540 aa  912    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  72.04 
 
 
528 aa  789    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  76.7 
 
 
528 aa  835    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  76.89 
 
 
528 aa  838    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  87.27 
 
 
542 aa  993    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  72.04 
 
 
528 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  79.22 
 
 
575 aa  913    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.65 
 
 
510 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  57.8 
 
 
510 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  81.02 
 
 
575 aa  923    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  80.52 
 
 
537 aa  906    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.23 
 
 
516 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  87.27 
 
 
542 aa  993    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.49 
 
 
516 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.11 
 
 
516 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.4 
 
 
513 aa  631  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  56.54 
 
 
518 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  56.23 
 
 
512 aa  626  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  56.54 
 
 
511 aa  626  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  55.45 
 
 
512 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  55.45 
 
 
515 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  55.45 
 
 
515 aa  622  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  55.45 
 
 
512 aa  621  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  55.51 
 
 
513 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.09 
 
 
510 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.23 
 
 
511 aa  622  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  55.98 
 
 
512 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  55.45 
 
 
512 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  55.45 
 
 
515 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  55.45 
 
 
515 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  55.45 
 
 
512 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  56.01 
 
 
516 aa  619  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.91 
 
 
512 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  55.06 
 
 
512 aa  618  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  55.68 
 
 
510 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  56.51 
 
 
560 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  55.25 
 
 
512 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  55.98 
 
 
533 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  56.37 
 
 
560 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  53.09 
 
 
514 aa  614  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  55.92 
 
 
506 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.6 
 
 
510 aa  609  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  54.76 
 
 
517 aa  609  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  52.8 
 
 
509 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  53 
 
 
509 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.42 
 
 
511 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  55.04 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  53.2 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.08 
 
 
511 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  53.79 
 
 
517 aa  595  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  54.72 
 
 
510 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  53.98 
 
 
522 aa  593  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  52.8 
 
 
513 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  52.13 
 
 
513 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  52.8 
 
 
513 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  52.8 
 
 
513 aa  586  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  53.86 
 
 
510 aa  588  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  52.58 
 
 
518 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  53.65 
 
 
514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  53.65 
 
 
514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  52.52 
 
 
507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  52.2 
 
 
518 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  52.96 
 
 
528 aa  579  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  53.97 
 
 
535 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  52.39 
 
 
518 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  52.83 
 
 
526 aa  580  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  52.65 
 
 
556 aa  580  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  53.07 
 
 
533 aa  581  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  54.11 
 
 
534 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  53.68 
 
 
512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  52.25 
 
 
529 aa  578  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  52.2 
 
 
518 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  53.38 
 
 
531 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  51.64 
 
 
520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  53.95 
 
 
565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  51.95 
 
 
511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  51.43 
 
 
517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  51.83 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  54.11 
 
 
527 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  52.8 
 
 
523 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  51.34 
 
 
520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  52.9 
 
 
516 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  53.19 
 
 
508 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  51.23 
 
 
542 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  52.41 
 
 
535 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  51.98 
 
 
526 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  51.43 
 
 
517 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  52.21 
 
 
540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.63 
 
 
517 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  52.01 
 
 
537 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  52.91 
 
 
512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>