More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0046 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  76.85 
 
 
537 aa  838    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  75.19 
 
 
528 aa  851    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  58.02 
 
 
517 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  81.63 
 
 
528 aa  904    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  90.53 
 
 
528 aa  998    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  77.67 
 
 
540 aa  834    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  93.56 
 
 
528 aa  1028    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  100 
 
 
528 aa  1085    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  74.62 
 
 
528 aa  848    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  80.97 
 
 
575 aa  869    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  59.85 
 
 
510 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  77.86 
 
 
540 aa  834    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  74.04 
 
 
528 aa  834    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  75.38 
 
 
528 aa  852    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  58.64 
 
 
516 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  58.64 
 
 
516 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  76.04 
 
 
575 aa  840    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  82.01 
 
 
528 aa  908    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  83.88 
 
 
548 aa  921    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  75.52 
 
 
542 aa  841    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  76.89 
 
 
542 aa  838    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  75.52 
 
 
542 aa  841    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  58.64 
 
 
513 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  58.43 
 
 
516 aa  628  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  59.03 
 
 
510 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.86 
 
 
516 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  56.76 
 
 
513 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  57.31 
 
 
512 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  57.36 
 
 
511 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  56.73 
 
 
515 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  56.73 
 
 
515 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  56.73 
 
 
515 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  56.73 
 
 
512 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  56.73 
 
 
512 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  56.35 
 
 
512 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  56.35 
 
 
515 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  56.35 
 
 
512 aa  608  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.92 
 
 
512 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  58.25 
 
 
506 aa  608  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  55.81 
 
 
518 aa  608  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.78 
 
 
511 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  56.35 
 
 
512 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  57.34 
 
 
510 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  56.15 
 
 
512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  53.98 
 
 
514 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.35 
 
 
510 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  57.67 
 
 
510 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  53.95 
 
 
512 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.59 
 
 
510 aa  597  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  55.04 
 
 
511 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  57.09 
 
 
509 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  54.68 
 
 
513 aa  594  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  54.48 
 
 
533 aa  588  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  55.05 
 
 
560 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  55.34 
 
 
528 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  55.95 
 
 
533 aa  590  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  54.76 
 
 
509 aa  590  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  56.16 
 
 
533 aa  586  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  56.68 
 
 
534 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  55.95 
 
 
556 aa  587  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.04 
 
 
511 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  56.98 
 
 
523 aa  585  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  55.81 
 
 
517 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  55.13 
 
 
560 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  55.04 
 
 
517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  53.01 
 
 
509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  52.82 
 
 
509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  55.58 
 
 
527 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  54.04 
 
 
513 aa  578  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  54.04 
 
 
513 aa  578  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  54.07 
 
 
507 aa  578  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.87 
 
 
526 aa  581  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  56.92 
 
 
525 aa  578  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  54.56 
 
 
522 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  52.57 
 
 
520 aa  579  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  54.08 
 
 
525 aa  581  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  53.85 
 
 
513 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  55.28 
 
 
514 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  55.28 
 
 
514 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54.56 
 
 
515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  55.77 
 
 
523 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  55.3 
 
 
516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  53.27 
 
 
542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  53.93 
 
 
517 aa  574  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  53.19 
 
 
508 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  52.82 
 
 
512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2949  GMP synthase  52.96 
 
 
526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  55.09 
 
 
515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  53.88 
 
 
523 aa  569  1e-161  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  52 
 
 
520 aa  571  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  53.2 
 
 
511 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  54.58 
 
 
526 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  55.21 
 
 
526 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  55.34 
 
 
524 aa  571  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  54.91 
 
 
518 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  53.56 
 
 
518 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  55.34 
 
 
535 aa  567  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  54.16 
 
 
513 aa  566  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  53.58 
 
 
531 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  54.65 
 
 
529 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>