More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1133 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  62.4 
 
 		 523 aa  667    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  61.61 
 
 		 512 aa  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  71.94 
 
 		 507 aa  767    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  61.42 
 
 		 515 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  61.42 
 
 		 515 aa  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  61.42 
 
 		 515 aa  655    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  60.43 
 
 		 510 aa  659    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  59.06 
 
 		 513 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  61.81 
 
 		 510 aa  661    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  63.39 
 
 		 511 aa  698    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  71.85 
 
 		 511 aa  773    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  61.42 
 
 		 512 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  61.22 
 
 		 512 aa  654    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  62.99 
 
 		 516 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  61.02 
 
 		 512 aa  646    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  62.8 
 
 		 512 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  62.01 
 
 		 512 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  73.23 
 
 		 511 aa  784    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  61.22 
 
 		 513 aa  678    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  59.37 
 
 		 513 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  61.81 
 
 		 512 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  65.81 
 
 		 509 aa  717    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  66.21 
 
 		 509 aa  720    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  100 
 
 		 508 aa  1047    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  61.42 
 
 		 512 aa  655    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  61.61 
 
 		 515 aa  656    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  61.42 
 
 		 512 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  59.37 
 
 		 513 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  61.42 
 
 		 510 aa  675    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  59.37 
 
 		 513 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  59.22 
 
 		 517 aa  630  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  58.59 
 
 		 520 aa  628  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.55 
 
 		 510 aa  623  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  57.62 
 
 		 520 aa  621  1e-177  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  57.28 
 
 		 509 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  57.06 
 
 		 517 aa  616  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  58.24 
 
 		 516 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  57.65 
 
 		 516 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.25 
 
 		 516 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.86 
 
 		 517 aa  610  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  55.6 
 
 		 513 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  56.75 
 
 		 514 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.51 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  56.92 
 
 		 506 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  55.66 
 
 		 533 aa  604  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  56.69 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  56.01 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  54.74 
 
 		 534 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  56.01 
 
 		 517 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  54.16 
 
 		 556 aa  592  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  55.97 
 
 		 518 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  55.88 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  54.53 
 
 		 528 aa  585  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  54.53 
 
 		 526 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  54.42 
 
 		 509 aa  586  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  55.71 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.71 
 
 		 511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  53.67 
 
 		 527 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  55.08 
 
 		 515 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  54.01 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  55.04 
 
 		 520 aa  580  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  53.7 
 
 		 518 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  54.6 
 
 		 525 aa  580  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  54.1 
 
 		 517 aa  579  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54.31 
 
 		 515 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  54.32 
 
 		 529 aa  581  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  52.94 
 
 		 535 aa  578  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  54.71 
 
 		 515 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  53.71 
 
 		 533 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  54.55 
 
 		 528 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  53.4 
 
 		 537 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  54.51 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  53.19 
 
 		 542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.65 
 
 		 526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  53.77 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  53.19 
 
 		 528 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  55.15 
 
 		 523 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  54.09 
 
 		 518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  53.12 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  52.93 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  53.74 
 
 		 511 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  53.42 
 
 		 517 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  53.71 
 
 		 517 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  54.09 
 
 		 518 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  53 
 
 		 528 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  53.77 
 
 		 528 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  53.89 
 
 		 518 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  53.38 
 
 		 528 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  52.8 
 
 		 528 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  53.37 
 
 		 527 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  54.49 
 
 		 517 aa  565  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.61 
 
 		 542 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  53.19 
 
 		 528 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  54.09 
 
 		 520 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  54.51 
 
 		 515 aa  567  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  52.25 
 
 		 517 aa  566  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.61 
 
 		 542 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  52.43 
 
 		 540 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.61 
 
 		 536 aa  561  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  53.1 
 
 		 515 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>