More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3833 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  74.76 
 
 		 523 aa  771    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  71.46 
 
 		 527 aa  728    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  100 
 
 		 517 aa  1034    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  71.9 
 
 		 523 aa  736    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  68.47 
 
 		 520 aa  709    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  73.32 
 
 		 526 aa  757    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  68.59 
 
 		 539 aa  700    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  70.76 
 
 		 525 aa  726    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  71.79 
 
 		 528 aa  745    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  76.36 
 
 		 519 aa  790    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  75.87 
 
 		 533 aa  766    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  75.58 
 
 		 515 aa  765    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  69.26 
 
 		 533 aa  714    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  72.67 
 
 		 527 aa  731    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  73.13 
 
 		 526 aa  758    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  94.58 
 
 		 517 aa  980    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  72.17 
 
 		 534 aa  744    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  70.83 
 
 		 529 aa  726    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0910  GMP synthase, large subunit  71.43 
 
 		 519 aa  741    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  75.44 
 
 		 516 aa  785    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  68.8 
 
 		 556 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  75.34 
 
 		 547 aa  775    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  72.25 
 
 		 522 aa  755    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  73.05 
 
 		 523 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  75.39 
 
 		 514 aa  773    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  72.15 
 
 		 519 aa  740    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  75.19 
 
 		 520 aa  773    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  72.15 
 
 		 519 aa  740    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  68.47 
 
 		 520 aa  717    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  71.1 
 
 		 535 aa  732    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  71.26 
 
 		 529 aa  735    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  71.98 
 
 		 524 aa  744    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  68.28 
 
 		 534 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  71.35 
 
 		 522 aa  727    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  71.46 
 
 		 527 aa  732    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  72.15 
 
 		 519 aa  740    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  72.17 
 
 		 522 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  72.64 
 
 		 517 aa  736    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  61.79 
 
 		 517 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  58.32 
 
 		 513 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  57.53 
 
 		 510 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  59.3 
 
 		 516 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  57.53 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  57.14 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  59.88 
 
 		 506 aa  589  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  55.19 
 
 		 512 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  58.59 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  54.01 
 
 		 517 aa  579  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  53.42 
 
 		 515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  53.42 
 
 		 515 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  53.42 
 
 		 515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  53.62 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  53.42 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  53.42 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.66 
 
 		 510 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  52.64 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  53.23 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  55.19 
 
 		 509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  55.19 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  53.03 
 
 		 512 aa  571  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.95 
 
 		 513 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  53.03 
 
 		 512 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  53.71 
 
 		 508 aa  568  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  53.03 
 
 		 515 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  55.08 
 
 		 516 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  53.71 
 
 		 511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  54.31 
 
 		 529 aa  563  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  52.12 
 
 		 520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  55.03 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.12 
 
 		 511 aa  559  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.61 
 
 		 511 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  54.86 
 
 		 516 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.71 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  53.4 
 
 		 531 aa  556  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  53.02 
 
 		 560 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  55.85 
 
 		 513 aa  554  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  53.7 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  54.4 
 
 		 510 aa  551  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  54.86 
 
 		 516 aa  555  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  51.27 
 
 		 517 aa  554  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  51.35 
 
 		 520 aa  550  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  52.87 
 
 		 537 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.27 
 
 		 530 aa  549  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  52.51 
 
 		 533 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  50.49 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  49.9 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  49.9 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  54.62 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  56.12 
 
 		 520 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.99 
 
 		 575 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  56.34 
 
 		 518 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  57.2 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  52.83 
 
 		 560 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  52.25 
 
 		 512 aa  542  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  53.85 
 
 		 528 aa  541  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  57.7 
 
 		 518 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  52.12 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  52.12 
 
 		 528 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  51.36 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  57.89 
 
 		 518 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>