More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0163 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  100 
 
 		 525 aa  1076    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.95 
 
 		 516 aa  633  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  58.61 
 
 		 517 aa  633  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  57.2 
 
 		 516 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  56.81 
 
 		 516 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  56.34 
 
 		 512 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  58.06 
 
 		 513 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  57.09 
 
 		 514 aa  609  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  58.2 
 
 		 514 aa  606  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  56.65 
 
 		 520 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  58.24 
 
 		 512 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.91 
 
 		 511 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  57.03 
 
 		 513 aa  601  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  57.03 
 
 		 513 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  57.03 
 
 		 513 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  58.11 
 
 		 518 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  56.65 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  54.28 
 
 		 511 aa  596  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.34 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  56.56 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  57.06 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  55.08 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  55.08 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  54.88 
 
 		 515 aa  591  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  55.08 
 
 		 515 aa  591  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  54.51 
 
 		 533 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  56.62 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  54.88 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  54.88 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  55.08 
 
 		 512 aa  588  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.89 
 
 		 511 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.88 
 
 		 512 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.4 
 
 		 509 aa  590  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  54.88 
 
 		 512 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  55.21 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.62 
 
 		 522 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  54.84 
 
 		 520 aa  588  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  56.14 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  54.88 
 
 		 512 aa  588  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  58.03 
 
 		 518 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  56.14 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  55.08 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.88 
 
 		 512 aa  588  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  58.03 
 
 		 518 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  54.19 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  54.53 
 
 		 517 aa  586  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  57.83 
 
 		 518 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  53.05 
 
 		 525 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.89 
 
 		 511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  54.69 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  53.14 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  54.01 
 
 		 525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  53.01 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  55.3 
 
 		 523 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  53.52 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  55.64 
 
 		 518 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  53.26 
 
 		 525 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  53.26 
 
 		 525 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  53.07 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  53.24 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  53.07 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  53.11 
 
 		 517 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.07 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.07 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  55.56 
 
 		 520 aa  581  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  54.08 
 
 		 528 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  53.07 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  53.07 
 
 		 525 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.69 
 
 		 542 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  53.05 
 
 		 525 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  55.77 
 
 		 524 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  53.14 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  53.05 
 
 		 525 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  54.58 
 
 		 510 aa  578  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  56.09 
 
 		 533 aa  581  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  52.48 
 
 		 525 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  54.41 
 
 		 523 aa  580  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  53.26 
 
 		 525 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.07 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  52.95 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  53.05 
 
 		 525 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  53.07 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  53.26 
 
 		 525 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.69 
 
 		 542 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  54.6 
 
 		 508 aa  580  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.07 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  54.3 
 
 		 524 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  54.73 
 
 		 520 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  52.11 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  53.7 
 
 		 528 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  52.94 
 
 		 528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.69 
 
 		 575 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  53.33 
 
 		 507 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  53.24 
 
 		 542 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  54.16 
 
 		 526 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  54.41 
 
 		 526 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  52.72 
 
 		 517 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  55.1 
 
 		 512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  52.48 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  52.48 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>