More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0189 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  76.26 
 
 		 535 aa  843    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  75.56 
 
 		 536 aa  838    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  100 
 
 		 529 aa  1093    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  77.1 
 
 		 530 aa  852    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  57.55 
 
 		 510 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.49 
 
 		 509 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  55.58 
 
 		 515 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  55.58 
 
 		 515 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  55.19 
 
 		 515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  55.58 
 
 		 515 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.05 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  55.58 
 
 		 512 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.3 
 
 		 509 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  55.58 
 
 		 512 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  55.58 
 
 		 512 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  55.38 
 
 		 512 aa  599  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  55.19 
 
 		 512 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  57.47 
 
 		 516 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  55.38 
 
 		 512 aa  598  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  55.38 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  55.26 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  55.85 
 
 		 506 aa  597  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  55.05 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  56.9 
 
 		 534 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  56.14 
 
 		 556 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  55.62 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  55.07 
 
 		 513 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  54.06 
 
 		 513 aa  589  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  55.07 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  55.16 
 
 		 516 aa  589  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  54.06 
 
 		 513 aa  589  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  54.62 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  55.83 
 
 		 512 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  53.38 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  55.17 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  54.98 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  54.79 
 
 		 507 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  53.88 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  55.77 
 
 		 516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.58 
 
 		 516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.96 
 
 		 516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  53.5 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  54.48 
 
 		 520 aa  579  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.54 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.26 
 
 		 511 aa  579  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  54.32 
 
 		 508 aa  581  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  55.07 
 
 		 533 aa  576  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  52.25 
 
 		 542 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  53.64 
 
 		 517 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.46 
 
 		 542 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.46 
 
 		 542 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  55.04 
 
 		 522 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  52.27 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  54.85 
 
 		 547 aa  568  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  55.58 
 
 		 527 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  54.06 
 
 		 526 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  52.91 
 
 		 537 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  53.77 
 
 		 529 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  55.28 
 
 		 518 aa  570  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  56.41 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  52.59 
 
 		 517 aa  567  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  54.44 
 
 		 528 aa  568  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.46 
 
 		 575 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  51.89 
 
 		 575 aa  566  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  53.5 
 
 		 520 aa  568  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.01 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  54.31 
 
 		 517 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  54.3 
 
 		 510 aa  565  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  51.87 
 
 		 528 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  53.46 
 
 		 511 aa  558  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  52.08 
 
 		 540 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  53.02 
 
 		 529 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  53.6 
 
 		 517 aa  555  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.5 
 
 		 526 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  52.86 
 
 		 518 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  52.81 
 
 		 528 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  53.82 
 
 		 514 aa  558  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  52.3 
 
 		 517 aa  555  1e-157  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.03 
 
 		 527 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  53.04 
 
 		 514 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  54.37 
 
 		 517 aa  552  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  52.7 
 
 		 533 aa  554  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  53.1 
 
 		 519 aa  551  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  51.31 
 
 		 528 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  53.12 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  53.04 
 
 		 514 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  53.8 
 
 		 523 aa  554  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  52.43 
 
 		 522 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  52.11 
 
 		 509 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  53.44 
 
 		 533 aa  551  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.01 
 
 		 533 aa  549  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  52.55 
 
 		 520 aa  551  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  53.7 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  52.58 
 
 		 516 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  50.38 
 
 		 528 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  53.44 
 
 		 518 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0910  GMP synthase, large subunit  53.32 
 
 		 519 aa  551  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  53.24 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  50.57 
 
 		 528 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  53.05 
 
 		 518 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>