More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0942 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  76.26 
 
 
529 aa  843    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  100 
 
 
535 aa  1095    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  81.72 
 
 
530 aa  899    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  81.09 
 
 
536 aa  907    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  57.2 
 
 
516 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  53.89 
 
 
509 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  53.7 
 
 
509 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  55.85 
 
 
510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  56.02 
 
 
556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  56.61 
 
 
534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  52.94 
 
 
508 aa  578  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  53.96 
 
 
510 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  53.77 
 
 
512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  53.22 
 
 
507 aa  567  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  54.99 
 
 
528 aa  567  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  53.18 
 
 
517 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  52.85 
 
 
512 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.54 
 
 
526 aa  565  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  55.22 
 
 
522 aa  566  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  55.89 
 
 
527 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  52.66 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  52.66 
 
 
515 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  52.66 
 
 
515 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  52.66 
 
 
515 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  53.48 
 
 
520 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  52.66 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  53.41 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  54.05 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  52.66 
 
 
515 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  52.66 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  52.47 
 
 
512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  52.66 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  55.01 
 
 
523 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  54.08 
 
 
506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  52.47 
 
 
512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  53.53 
 
 
520 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  51.96 
 
 
516 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  52.52 
 
 
516 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  52.42 
 
 
520 aa  560  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  53.21 
 
 
533 aa  558  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  52.71 
 
 
516 aa  561  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.44 
 
 
516 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.38 
 
 
527 aa  561  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  51.8 
 
 
513 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  52.28 
 
 
517 aa  560  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  52.54 
 
 
511 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  51.71 
 
 
517 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  55.03 
 
 
517 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.2 
 
 
510 aa  560  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  54.99 
 
 
520 aa  556  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  54.32 
 
 
547 aa  558  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  52.35 
 
 
510 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  53.57 
 
 
510 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  53.48 
 
 
526 aa  554  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  54.46 
 
 
514 aa  554  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  50.28 
 
 
511 aa  555  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  54.89 
 
 
517 aa  555  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  54.75 
 
 
518 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  53.86 
 
 
523 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  54.55 
 
 
517 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  50.84 
 
 
513 aa  548  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.08 
 
 
510 aa  551  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  54.24 
 
 
520 aa  548  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  53.89 
 
 
517 aa  548  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  51.78 
 
 
513 aa  551  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  52.76 
 
 
529 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  54.32 
 
 
519 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  50.56 
 
 
513 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  53.08 
 
 
519 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  53.08 
 
 
519 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  53.08 
 
 
519 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  50.56 
 
 
513 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  51.21 
 
 
540 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  54.06 
 
 
515 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  52.02 
 
 
529 aa  542  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  51.78 
 
 
575 aa  543  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  53.67 
 
 
535 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  53.32 
 
 
534 aa  542  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  52.22 
 
 
524 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  52.74 
 
 
511 aa  545  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  54.05 
 
 
533 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  51.32 
 
 
523 aa  539  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  51.4 
 
 
540 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  52.82 
 
 
528 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  52.04 
 
 
528 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  50.95 
 
 
514 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  53.48 
 
 
515 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  53.37 
 
 
528 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.25 
 
 
539 aa  539  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  52.67 
 
 
527 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0910  GMP synthase, large subunit  52.34 
 
 
519 aa  541  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  52.27 
 
 
509 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  52.84 
 
 
516 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  52.85 
 
 
560 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  49.81 
 
 
575 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  51.8 
 
 
518 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  52.28 
 
 
560 aa  532  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  50.65 
 
 
542 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  51.2 
 
 
537 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  50.65 
 
 
542 aa  531  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>