More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0231 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  69.76 
 
 		 513 aa  747    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  69.69 
 
 		 512 aa  758    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  69.09 
 
 		 512 aa  751    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  69.71 
 
 		 520 aa  756    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  69.96 
 
 		 513 aa  748    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  70.47 
 
 		 510 aa  760    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  69.09 
 
 		 515 aa  751    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  69.09 
 
 		 515 aa  752    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  69.09 
 
 		 515 aa  751    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  82.21 
 
 		 517 aa  896    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  69.49 
 
 		 512 aa  756    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  69.09 
 
 		 512 aa  751    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  63.71 
 
 		 511 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  69.09 
 
 		 512 aa  751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  59.06 
 
 		 514 aa  642    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  69.49 
 
 		 512 aa  754    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.71 
 
 		 510 aa  643    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  61.22 
 
 		 516 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  62.13 
 
 		 511 aa  657    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  60.08 
 
 		 512 aa  634    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  60.24 
 
 		 510 aa  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  59.17 
 
 		 511 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  69.09 
 
 		 515 aa  751    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  71.85 
 
 		 512 aa  771    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  69.49 
 
 		 512 aa  754    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  58.3 
 
 		 506 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  69.96 
 
 		 513 aa  748    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  61.61 
 
 		 509 aa  682    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  61.81 
 
 		 509 aa  683    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  58.86 
 
 		 510 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  67.5 
 
 		 513 aa  745    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  69.47 
 
 		 517 aa  740    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  100 
 
 		 517 aa  1057    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  68.47 
 
 		 520 aa  748    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  60.28 
 
 		 510 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  59.65 
 
 		 513 aa  660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  64.62 
 
 		 509 aa  697    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  58.1 
 
 		 513 aa  635    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.1 
 
 		 510 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  57.42 
 
 		 517 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  59.65 
 
 		 511 aa  622  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  57.59 
 
 		 507 aa  624  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  57.06 
 
 		 508 aa  616  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  55.21 
 
 		 556 aa  617  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  56.03 
 
 		 533 aa  615  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  54.83 
 
 		 534 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.88 
 
 		 516 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  57.56 
 
 		 523 aa  610  1e-173  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  54.76 
 
 		 542 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.29 
 
 		 516 aa  611  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  56.56 
 
 		 533 aa  605  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  55.15 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  54.16 
 
 		 575 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  55.69 
 
 		 516 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  56.72 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  55.15 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  56.36 
 
 		 560 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  57.37 
 
 		 510 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  55.53 
 
 		 575 aa  604  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  55.92 
 
 		 540 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  55.84 
 
 		 560 aa  599  1e-170  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  54.89 
 
 		 527 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  54.05 
 
 		 523 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  56.01 
 
 		 528 aa  594  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  55.81 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  54.99 
 
 		 518 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  54.28 
 
 		 518 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  52.49 
 
 		 526 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  52.98 
 
 		 528 aa  591  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  55.62 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  53.99 
 
 		 540 aa  588  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  54.37 
 
 		 533 aa  589  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  53.38 
 
 		 529 aa  588  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  54.17 
 
 		 537 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  55.23 
 
 		 511 aa  586  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  55.82 
 
 		 511 aa  588  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  54.53 
 
 		 525 aa  586  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  53.38 
 
 		 520 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  55.81 
 
 		 528 aa  587  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  55.81 
 
 		 528 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  54.83 
 
 		 511 aa  586  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  53.76 
 
 		 517 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  55.03 
 
 		 511 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.01 
 
 		 509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  54.86 
 
 		 526 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  55.23 
 
 		 528 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  56.42 
 
 		 556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  52.98 
 
 		 522 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  55.23 
 
 		 528 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  53.24 
 
 		 525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  56.01 
 
 		 528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  55.42 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  55.42 
 
 		 511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  56.39 
 
 		 507 aa  579  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  51.43 
 
 		 532 aa  579  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  56.23 
 
 		 535 aa  578  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  52.45 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  53.23 
 
 		 519 aa  578  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  53.52 
 
 		 514 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  53.52 
 
 		 514 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>