More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1583 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  70.69 
 
 
515 aa  765    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  69.23 
 
 
513 aa  748    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  70.69 
 
 
512 aa  764    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  81.21 
 
 
520 aa  868    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  70.1 
 
 
512 aa  758    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  69.82 
 
 
515 aa  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  69.82 
 
 
515 aa  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  69.82 
 
 
515 aa  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  59.25 
 
 
511 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  67.45 
 
 
517 aa  737    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  68.84 
 
 
513 aa  751    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  71.01 
 
 
510 aa  771    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  59.96 
 
 
510 aa  648    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  69.82 
 
 
512 aa  760    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  69.82 
 
 
512 aa  760    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  70.22 
 
 
512 aa  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  59.37 
 
 
516 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  70.41 
 
 
512 aa  766    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  58.61 
 
 
509 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  58.42 
 
 
509 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  70.5 
 
 
512 aa  763    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  59.96 
 
 
509 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  68.84 
 
 
513 aa  751    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  100 
 
 
513 aa  1050    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  67.58 
 
 
517 aa  717    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  67.5 
 
 
517 aa  745    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  80.04 
 
 
520 aa  860    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  70.02 
 
 
512 aa  760    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  57.68 
 
 
511 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  55.75 
 
 
513 aa  621  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.02 
 
 
510 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.68 
 
 
510 aa  618  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  55.23 
 
 
513 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.42 
 
 
516 aa  614  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  56.53 
 
 
516 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  56.02 
 
 
510 aa  611  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  56.34 
 
 
516 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  56.24 
 
 
506 aa  610  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  54.3 
 
 
514 aa  610  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  55.73 
 
 
507 aa  608  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  55.6 
 
 
508 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  55.45 
 
 
517 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  56.12 
 
 
528 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.31 
 
 
511 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  55.13 
 
 
518 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  55.19 
 
 
533 aa  596  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.03 
 
 
510 aa  596  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  54.46 
 
 
575 aa  597  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  54.26 
 
 
556 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  53.68 
 
 
534 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  54.68 
 
 
528 aa  594  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  53.29 
 
 
542 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  53.29 
 
 
542 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  53.59 
 
 
516 aa  594  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.42 
 
 
511 aa  594  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  55.15 
 
 
528 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  55.53 
 
 
533 aa  588  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  52.13 
 
 
542 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  55.71 
 
 
523 aa  588  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  55.53 
 
 
560 aa  586  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  54.25 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  54.37 
 
 
528 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  54.56 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.83 
 
 
512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  54.35 
 
 
518 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  54.55 
 
 
518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  52.91 
 
 
575 aa  582  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  55.58 
 
 
560 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  53.5 
 
 
529 aa  584  1.0000000000000001e-165  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  53.46 
 
 
533 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  54.94 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  55.82 
 
 
510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  53.4 
 
 
528 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  54.21 
 
 
516 aa  579  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  52.08 
 
 
528 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  55.38 
 
 
522 aa  581  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  55.13 
 
 
518 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  54.9 
 
 
512 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  54.76 
 
 
548 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  54.64 
 
 
511 aa  580  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  53.77 
 
 
527 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  54.53 
 
 
511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  54.67 
 
 
514 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  54.51 
 
 
512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  54.17 
 
 
515 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.31 
 
 
517 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  54.18 
 
 
525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  54.33 
 
 
510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  54.67 
 
 
514 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  54.71 
 
 
518 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  54.58 
 
 
513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.54 
 
 
526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  53.11 
 
 
537 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  53.71 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  52.33 
 
 
540 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  51.52 
 
 
528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  51.95 
 
 
540 aa  572  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  53.61 
 
 
525 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  53.33 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  54.51 
 
 
517 aa  575  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>