More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2260 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  65.16 
 
 		 513 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  64.37 
 
 		 512 aa  698    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  63.24 
 
 		 523 aa  671    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  65.35 
 
 		 513 aa  702    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  64.17 
 
 		 512 aa  696    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  58.46 
 
 		 520 aa  641    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  64.37 
 
 		 510 aa  696    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  64.17 
 
 		 512 aa  695    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  63.78 
 
 		 515 aa  693    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  63.78 
 
 		 515 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  63.78 
 
 		 515 aa  693    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  59.37 
 
 		 517 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  63.12 
 
 		 513 aa  686    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  59.14 
 
 		 509 aa  657    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  64.17 
 
 		 515 aa  696    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  59.76 
 
 		 516 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  64.69 
 
 		 510 aa  717    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  59.65 
 
 		 510 aa  635    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  63.98 
 
 		 512 aa  696    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  63.19 
 
 		 510 aa  691    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  70.08 
 
 		 511 aa  742    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  63.78 
 
 		 512 aa  693    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  66.73 
 
 		 511 aa  726    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  62.99 
 
 		 512 aa  691    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  63.46 
 
 		 516 aa  705    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  63.71 
 
 		 512 aa  696    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  59.76 
 
 		 516 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.86 
 
 		 510 aa  647    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  62.99 
 
 		 513 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  59.37 
 
 		 511 aa  635    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  68.5 
 
 		 511 aa  738    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  60.55 
 
 		 516 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  99.61 
 
 		 509 aa  1045    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  100 
 
 		 509 aa  1048    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  66.47 
 
 		 507 aa  716    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  65.16 
 
 		 513 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  62.6 
 
 		 510 aa  672    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  61.22 
 
 		 510 aa  641    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  58.42 
 
 		 513 aa  639    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  61.81 
 
 		 517 aa  683    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  58.86 
 
 		 520 aa  648    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  63.78 
 
 		 512 aa  693    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  66.21 
 
 		 508 aa  720    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  60.04 
 
 		 517 aa  658    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  64.37 
 
 		 512 aa  706    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  55.73 
 
 		 506 aa  631  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  55.99 
 
 		 533 aa  629  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  58.25 
 
 		 520 aa  626  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  57.45 
 
 		 516 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  57.83 
 
 		 527 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  57.67 
 
 		 520 aa  623  1e-177  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.22 
 
 		 526 aa  623  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  56.78 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  58.22 
 
 		 526 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  56.59 
 
 		 534 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  54.93 
 
 		 575 aa  615  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  58.07 
 
 		 518 aa  616  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  56.75 
 
 		 518 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  54.93 
 
 		 540 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  57.53 
 
 		 523 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  56.39 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  56.29 
 
 		 528 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  53.58 
 
 		 575 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  56.7 
 
 		 515 aa  605  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  53 
 
 		 542 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  55.8 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  57.37 
 
 		 510 aa  604  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  57.06 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  53.77 
 
 		 537 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  57.39 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  57.34 
 
 		 518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  54.3 
 
 		 529 aa  604  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  53.19 
 
 		 542 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  53.77 
 
 		 540 aa  598  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  54.81 
 
 		 509 aa  598  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  57.14 
 
 		 518 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  57.28 
 
 		 533 aa  601  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  53.19 
 
 		 542 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  56.01 
 
 		 529 aa  601  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  56.48 
 
 		 547 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  56.56 
 
 		 518 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  55.17 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  54.42 
 
 		 515 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  56.12 
 
 		 524 aa  594  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  54.1 
 
 		 523 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  55.88 
 
 		 514 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  55.17 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  53.36 
 
 		 511 aa  589  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  55.53 
 
 		 534 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  56.73 
 
 		 523 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  55.34 
 
 		 520 aa  591  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  54.84 
 
 		 529 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  56.5 
 
 		 535 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  53.7 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  53.41 
 
 		 515 aa  589  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54.42 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  55.36 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  54.4 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  54.79 
 
 		 522 aa  588  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  55.56 
 
 		 522 aa  588  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>