More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0337 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  100 
 
 
510 aa  1040    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  57.37 
 
 
509 aa  604  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  57.17 
 
 
509 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  57.37 
 
 
517 aa  601  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.27 
 
 
512 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  54.99 
 
 
510 aa  588  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  54.19 
 
 
512 aa  585  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  56.36 
 
 
511 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.3 
 
 
511 aa  587  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  54 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.19 
 
 
512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.19 
 
 
512 aa  579  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  53.92 
 
 
515 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  53.92 
 
 
515 aa  581  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  53.92 
 
 
515 aa  580  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  55.01 
 
 
517 aa  580  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  54.19 
 
 
512 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.19 
 
 
512 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  53.92 
 
 
515 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  53.8 
 
 
512 aa  579  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  54.9 
 
 
520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  54.33 
 
 
513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  55.19 
 
 
511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  54.31 
 
 
520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  54.01 
 
 
511 aa  569  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  54.31 
 
 
513 aa  568  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  52.45 
 
 
513 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  52.45 
 
 
510 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  53.62 
 
 
513 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  53.62 
 
 
513 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  53.35 
 
 
508 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  52.37 
 
 
509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.69 
 
 
510 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  53.03 
 
 
510 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  53.03 
 
 
510 aa  559  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  51.58 
 
 
516 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  52.54 
 
 
517 aa  553  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  51.07 
 
 
516 aa  548  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  50.68 
 
 
516 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  51.46 
 
 
516 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  51.96 
 
 
514 aa  546  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  50.49 
 
 
517 aa  545  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  51.47 
 
 
512 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  51.46 
 
 
513 aa  542  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  51.56 
 
 
511 aa  544  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  50.98 
 
 
511 aa  544  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  51.78 
 
 
507 aa  543  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  51.98 
 
 
506 aa  544  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  50.58 
 
 
518 aa  542  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  52.34 
 
 
510 aa  543  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  52.27 
 
 
507 aa  538  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  50.39 
 
 
533 aa  538  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.66 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  49.62 
 
 
542 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  50.2 
 
 
513 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  51.87 
 
 
512 aa  539  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  51.65 
 
 
513 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  49.62 
 
 
542 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  52.04 
 
 
513 aa  536  1e-151  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  49.81 
 
 
528 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  54.04 
 
 
512 aa  538  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  50.78 
 
 
511 aa  537  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  49.32 
 
 
513 aa  535  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  49.32 
 
 
518 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  50.78 
 
 
517 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  49.23 
 
 
542 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  48.85 
 
 
537 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  50.49 
 
 
513 aa  531  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  49.9 
 
 
523 aa  529  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  51.64 
 
 
525 aa  528  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  51.08 
 
 
509 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  50.58 
 
 
518 aa  529  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  51.18 
 
 
517 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  49.32 
 
 
534 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  51.76 
 
 
513 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  48.94 
 
 
522 aa  528  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  50.29 
 
 
533 aa  525  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  51.18 
 
 
517 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  48.27 
 
 
575 aa  525  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  51.85 
 
 
515 aa  527  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  50 
 
 
527 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.98 
 
 
517 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  49.23 
 
 
575 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  51.95 
 
 
512 aa  527  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  50.1 
 
 
560 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  49.42 
 
 
528 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  49.9 
 
 
560 aa  525  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  49.02 
 
 
511 aa  525  1e-147  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  50.98 
 
 
531 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  51.06 
 
 
516 aa  521  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  48.66 
 
 
528 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  49.71 
 
 
518 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  49.52 
 
 
556 aa  525  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  48.83 
 
 
511 aa  524  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  50.1 
 
 
518 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  48.66 
 
 
528 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  49.02 
 
 
510 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  49.02 
 
 
511 aa  524  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  48.83 
 
 
511 aa  525  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  50.1 
 
 
513 aa  524  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>