More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1806 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  70.39 
 
 		 515 aa  768    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  61.22 
 
 		 516 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  59.84 
 
 		 516 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  70.18 
 
 		 515 aa  753    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  61.22 
 
 		 516 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  78.71 
 
 		 516 aa  838    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  60.04 
 
 		 517 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  80.82 
 
 		 515 aa  869    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  61.1 
 
 		 518 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  100 
 
 		 511 aa  1048    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  82.19 
 
 		 515 aa  881    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  56.69 
 
 		 514 aa  632  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  58.98 
 
 		 518 aa  624  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  58.78 
 
 		 516 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  58.79 
 
 		 518 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  58.79 
 
 		 518 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  58.51 
 
 		 511 aa  622  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  58.59 
 
 		 518 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  57.4 
 
 		 512 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  57.2 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  57 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  56.69 
 
 		 509 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  57.2 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  57.2 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.41 
 
 		 513 aa  608  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  58.59 
 
 		 528 aa  609  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.21 
 
 		 510 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  58.17 
 
 		 519 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.51 
 
 		 522 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  56.42 
 
 		 520 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  57.45 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  56.41 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  56.23 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.91 
 
 		 511 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  57.62 
 
 		 556 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54.99 
 
 		 515 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  56.7 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  57.12 
 
 		 519 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  57.39 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  56.42 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  58.32 
 
 		 524 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  56.84 
 
 		 565 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  54.64 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  56.03 
 
 		 520 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  54.69 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  56.23 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  56.81 
 
 		 526 aa  594  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  54.44 
 
 		 512 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  54.44 
 
 		 515 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  54.44 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  54.44 
 
 		 515 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  56.2 
 
 		 518 aa  588  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.44 
 
 		 512 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  54.67 
 
 		 575 aa  589  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.4 
 
 		 509 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  55.04 
 
 		 523 aa  590  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  53.31 
 
 		 575 aa  588  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  56.23 
 
 		 523 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.83 
 
 		 512 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  54.64 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.04 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.04 
 
 		 515 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  53.94 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  56.25 
 
 		 535 aa  587  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  54.44 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  54.09 
 
 		 537 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  56.14 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  56.23 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  55.03 
 
 		 527 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  55.71 
 
 		 540 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  55.71 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.4 
 
 		 509 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  54.04 
 
 		 513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  54.04 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  56.25 
 
 		 520 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  56.64 
 
 		 520 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  56.16 
 
 		 516 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  55.56 
 
 		 530 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  56.25 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  55.21 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  53.98 
 
 		 528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  54.04 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  54.81 
 
 		 517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  55.86 
 
 		 508 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  54.65 
 
 		 527 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.55 
 
 		 525 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  54.46 
 
 		 527 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.62 
 
 		 517 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  56.19 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  53.25 
 
 		 513 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  52.92 
 
 		 540 aa  578  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  56.02 
 
 		 513 aa  578  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  55.06 
 
 		 520 aa  578  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  54.55 
 
 		 529 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  55.13 
 
 		 526 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  55.82 
 
 		 506 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  55.32 
 
 		 525 aa  581  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  55.8 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  55.21 
 
 		 531 aa  579  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  55.06 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>