More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  85.74 
 
 		 519 aa  894    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  77.86 
 
 		 522 aa  814    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  74.17 
 
 		 527 aa  754    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  76.55 
 
 		 533 aa  781    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  75.15 
 
 		 523 aa  747    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  74.71 
 
 		 523 aa  779    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  67.95 
 
 		 520 aa  715    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  74.56 
 
 		 528 aa  764    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  67.88 
 
 		 520 aa  724    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  70.91 
 
 		 533 aa  736    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  72.45 
 
 		 539 aa  735    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  73.45 
 
 		 524 aa  754    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  74.03 
 
 		 523 aa  769    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  75.2 
 
 		 517 aa  772    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  62.75 
 
 		 516 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  69.32 
 
 		 556 aa  694    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  75.39 
 
 		 517 aa  773    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  73.65 
 
 		 527 aa  759    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  75.53 
 
 		 520 aa  776    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  75.78 
 
 		 526 aa  779    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  72.87 
 
 		 534 aa  746    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  78.91 
 
 		 519 aa  815    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  72.34 
 
 		 529 aa  748    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  78.24 
 
 		 525 aa  820    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  72.53 
 
 		 529 aa  749    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  74.95 
 
 		 516 aa  790    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  71.62 
 
 		 522 aa  734    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  100 
 
 		 514 aa  1028    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  75.39 
 
 		 535 aa  780    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  75.73 
 
 		 526 aa  779    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  74.52 
 
 		 527 aa  762    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  76.64 
 
 		 547 aa  790    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  78.91 
 
 		 519 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  79.22 
 
 		 522 aa  826    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  78.91 
 
 		 519 aa  815    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  72.48 
 
 		 534 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  77.09 
 
 		 515 aa  786    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0910  GMP synthase, large subunit  75.44 
 
 		 519 aa  787    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  74.22 
 
 		 517 aa  750    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  61.79 
 
 		 517 aa  624  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  62.75 
 
 		 506 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  60.86 
 
 		 533 aa  612  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  59.22 
 
 		 510 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  58.87 
 
 		 513 aa  608  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  57.45 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  56.08 
 
 		 509 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  55.88 
 
 		 509 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.12 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.5 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.86 
 
 		 512 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  55.49 
 
 		 515 aa  585  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.95 
 
 		 510 aa  586  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  58.98 
 
 		 518 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.81 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  55.49 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.6 
 
 		 511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  54.79 
 
 		 517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  55.49 
 
 		 515 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  55.49 
 
 		 515 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  55.49 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  55.49 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  55.29 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  55.49 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  54.9 
 
 		 512 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  54.9 
 
 		 512 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  54.26 
 
 		 511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  54.51 
 
 		 508 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  54.51 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  58.82 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  59.77 
 
 		 518 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  59.38 
 
 		 518 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  59.57 
 
 		 518 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.99 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  53.23 
 
 		 517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  55.34 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  55.13 
 
 		 515 aa  567  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  54.99 
 
 		 511 aa  567  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.29 
 
 		 511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  53.41 
 
 		 533 aa  559  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  52.46 
 
 		 513 aa  559  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  51.87 
 
 		 513 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  54.79 
 
 		 528 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  53.41 
 
 		 560 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  53.02 
 
 		 560 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  52.55 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  51.87 
 
 		 513 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  53.23 
 
 		 507 aa  556  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  53.82 
 
 		 529 aa  558  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  54.6 
 
 		 528 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  53.42 
 
 		 517 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  51.66 
 
 		 514 aa  555  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.46 
 
 		 530 aa  555  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  52.51 
 
 		 575 aa  558  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  55.29 
 
 		 509 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  52.76 
 
 		 528 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  52.83 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  53.09 
 
 		 540 aa  554  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  54.46 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  53.67 
 
 		 575 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  52.63 
 
 		 520 aa  554  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>