More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1718 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  100 
 
 		 523 aa  1075    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  64.64 
 
 		 511 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  62.4 
 
 		 508 aa  667    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  61.69 
 
 		 511 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  61.22 
 
 		 511 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  63.04 
 
 		 509 aa  672    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  63.24 
 
 		 509 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  59.68 
 
 		 507 aa  645    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  58.86 
 
 		 510 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  57.73 
 
 		 516 aa  626  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  58.07 
 
 		 512 aa  624  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  57.45 
 
 		 513 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  57.53 
 
 		 512 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  56.89 
 
 		 515 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  57.14 
 
 		 512 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  57.28 
 
 		 515 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  57.53 
 
 		 512 aa  617  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  56.89 
 
 		 515 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  56.89 
 
 		 515 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  57.34 
 
 		 512 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  57.14 
 
 		 512 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  57.14 
 
 		 512 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  57.34 
 
 		 512 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  57.48 
 
 		 513 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.89 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  57.56 
 
 		 517 aa  610  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  56.16 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  55.31 
 
 		 509 aa  606  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  56.18 
 
 		 520 aa  598  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  55.91 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  55.58 
 
 		 513 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  55.58 
 
 		 513 aa  596  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  55.58 
 
 		 513 aa  596  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.75 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.76 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  56.95 
 
 		 520 aa  597  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  56.19 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.69 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  55.71 
 
 		 513 aa  588  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.77 
 
 		 516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  56.08 
 
 		 514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  55.91 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.19 
 
 		 516 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  55.77 
 
 		 516 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.94 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  55.43 
 
 		 528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  53.31 
 
 		 528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  53.55 
 
 		 520 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  53.31 
 
 		 528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  53.49 
 
 		 528 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.02 
 
 		 542 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  53.88 
 
 		 528 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  53.38 
 
 		 537 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  55.29 
 
 		 517 aa  571  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.02 
 
 		 542 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.22 
 
 		 575 aa  566  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  54.13 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  52.8 
 
 		 575 aa  565  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  53.31 
 
 		 533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  53.68 
 
 		 528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  54.46 
 
 		 515 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  53.11 
 
 		 560 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54.93 
 
 		 515 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  53.29 
 
 		 528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  53.49 
 
 		 528 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  54.17 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  52.96 
 
 		 506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  53.31 
 
 		 560 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  51.06 
 
 		 542 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  51.45 
 
 		 540 aa  558  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  52.37 
 
 		 526 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  54.14 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  52.41 
 
 		 548 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  53.54 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  53.88 
 
 		 515 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  52.79 
 
 		 525 aa  558  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  53.38 
 
 		 516 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  52.79 
 
 		 521 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  52.43 
 
 		 518 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  53.1 
 
 		 528 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  51.46 
 
 		 518 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  53.23 
 
 		 518 aa  558  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  52.23 
 
 		 518 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  53.98 
 
 		 520 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  51.45 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  52.9 
 
 		 527 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  54.37 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  51.65 
 
 		 518 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  52.59 
 
 		 522 aa  551  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  51.26 
 
 		 540 aa  551  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  52.33 
 
 		 533 aa  549  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  51.82 
 
 		 522 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.64 
 
 		 517 aa  548  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  51.77 
 
 		 539 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  53.97 
 
 		 533 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  52.92 
 
 		 511 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  50.97 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  53.7 
 
 		 535 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  53.27 
 
 		 542 aa  545  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  52.25 
 
 		 517 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>