More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0237 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  82.62 
 
 
512 aa  897    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  61.57 
 
 
517 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  73.63 
 
 
513 aa  797    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  68.11 
 
 
509 aa  726    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  82.62 
 
 
512 aa  897    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  62.7 
 
 
512 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  72.16 
 
 
520 aa  783    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  64.24 
 
 
511 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  59.61 
 
 
516 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  82.23 
 
 
515 aa  892    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  82.23 
 
 
515 aa  894    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  82.23 
 
 
515 aa  892    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  82.42 
 
 
515 aa  895    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  60.83 
 
 
510 aa  637    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  59.02 
 
 
516 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  59.3 
 
 
533 aa  646    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  64.71 
 
 
511 aa  693    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  82.42 
 
 
512 aa  894    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  62.92 
 
 
511 aa  659    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  71.46 
 
 
517 aa  766    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  57.98 
 
 
514 aa  641    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  65.75 
 
 
516 aa  714    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  82.03 
 
 
512 aa  892    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  67.58 
 
 
510 aa  737    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  89.98 
 
 
510 aa  962    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  60.16 
 
 
507 aa  656    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  63.71 
 
 
513 aa  684    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  64.64 
 
 
513 aa  706    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.53 
 
 
510 aa  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  60.28 
 
 
506 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  82.42 
 
 
512 aa  896    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  64.17 
 
 
509 aa  707    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  64.37 
 
 
509 aa  706    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  59.41 
 
 
516 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  62.8 
 
 
508 aa  667    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  83.79 
 
 
512 aa  906    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  62.67 
 
 
510 aa  677    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  73.44 
 
 
513 aa  801    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  70.41 
 
 
513 aa  766    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  64.98 
 
 
517 aa  697    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  71.85 
 
 
517 aa  771    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  71.18 
 
 
520 aa  778    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  82.42 
 
 
512 aa  894    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  63.33 
 
 
511 aa  693    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  100 
 
 
512 aa  1058    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  66.34 
 
 
510 aa  706    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  73.44 
 
 
513 aa  801    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  58.11 
 
 
537 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  60.08 
 
 
518 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  58.49 
 
 
518 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.07 
 
 
510 aa  628  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  57.53 
 
 
575 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  59.22 
 
 
533 aa  625  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  59.61 
 
 
514 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  58.07 
 
 
523 aa  624  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  58.53 
 
 
556 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  59.61 
 
 
514 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  56.76 
 
 
542 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  56.76 
 
 
542 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  58.24 
 
 
516 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  58.51 
 
 
512 aa  622  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  56.76 
 
 
575 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  55.98 
 
 
542 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  58.16 
 
 
528 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  57.58 
 
 
528 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  57.2 
 
 
528 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  58.49 
 
 
518 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  58.25 
 
 
560 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  57.77 
 
 
528 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  57.4 
 
 
511 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  57.14 
 
 
540 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  57.01 
 
 
528 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  57.31 
 
 
528 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  58.3 
 
 
518 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  58.3 
 
 
518 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  58.25 
 
 
560 aa  616  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  57.45 
 
 
511 aa  615  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  58.12 
 
 
512 aa  615  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  58.43 
 
 
511 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  56.54 
 
 
528 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  56.43 
 
 
528 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  57.28 
 
 
533 aa  612  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  56.62 
 
 
528 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  57.85 
 
 
527 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  57.67 
 
 
520 aa  613  9.999999999999999e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  57.59 
 
 
534 aa  614  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  56.37 
 
 
540 aa  610  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  58.24 
 
 
511 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  56.92 
 
 
528 aa  610  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  58.04 
 
 
511 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  56.7 
 
 
520 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  56.89 
 
 
515 aa  606  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  57.09 
 
 
520 aa  606  9.999999999999999e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  56.81 
 
 
517 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  55.66 
 
 
526 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  55.26 
 
 
520 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  56.25 
 
 
515 aa  598  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.09 
 
 
526 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  56.7 
 
 
522 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  56.97 
 
 
513 aa  600  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>