More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3123 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  60.77 
 
 		 528 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  63.41 
 
 		 533 aa  664    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  60.96 
 
 		 520 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  59.45 
 
 		 511 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  100 
 
 		 516 aa  1061    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  60.08 
 
 		 521 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  60.31 
 
 		 513 aa  673    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  60.71 
 
 		 512 aa  664    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  59.61 
 
 		 512 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  57.9 
 
 		 525 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  63.01 
 
 		 560 aa  667    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  60.96 
 
 		 520 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  81.94 
 
 		 517 aa  914    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  59.84 
 
 		 511 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  60.51 
 
 		 515 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  60.51 
 
 		 515 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  60.51 
 
 		 515 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  60.2 
 
 		 513 aa  663    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  61.12 
 
 		 518 aa  684    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  60.77 
 
 		 520 aa  652    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  59.92 
 
 		 518 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  63.41 
 
 		 560 aa  667    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  61.73 
 
 		 520 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  58.69 
 
 		 520 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  62.38 
 
 		 535 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  57.59 
 
 		 540 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  60.08 
 
 		 521 aa  634    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  59.46 
 
 		 524 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  88.95 
 
 		 516 aa  964    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  60.51 
 
 		 512 aa  662    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  63.87 
 
 		 510 aa  692    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  57.23 
 
 		 542 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  57.42 
 
 		 542 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  61.37 
 
 		 515 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  65.5 
 
 		 514 aa  707    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  61.42 
 
 		 525 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  60.77 
 
 		 520 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  60.08 
 
 		 516 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  59.18 
 
 		 512 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  60.51 
 
 		 512 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  60.12 
 
 		 512 aa  656    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  61.01 
 
 		 524 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  57.23 
 
 		 575 aa  652    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  57.42 
 
 		 542 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  62.79 
 
 		 525 aa  659    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  62.55 
 
 		 516 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  60.96 
 
 		 520 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  61.7 
 
 		 518 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  61.7 
 
 		 518 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  62.21 
 
 		 540 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  60.43 
 
 		 511 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  61.21 
 
 		 535 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  61.15 
 
 		 520 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  60.71 
 
 		 515 aa  664    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  59.18 
 
 		 510 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  61.82 
 
 		 556 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  60.47 
 
 		 541 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  61.2 
 
 		 540 aa  653    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  62.16 
 
 		 515 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  60.31 
 
 		 512 aa  660    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  58.95 
 
 		 515 aa  636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  61.9 
 
 		 518 aa  681    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  60.51 
 
 		 512 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  59.88 
 
 		 515 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  60.77 
 
 		 520 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  61.15 
 
 		 518 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  61.42 
 
 		 509 aa  671    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  60.04 
 
 		 519 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  61.99 
 
 		 534 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  60.75 
 
 		 509 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  60.55 
 
 		 509 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  60.27 
 
 		 521 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  56.81 
 
 		 575 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  62.87 
 
 		 514 aa  687    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  61.37 
 
 		 510 aa  672    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  60.19 
 
 		 522 aa  656    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  61.79 
 
 		 518 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  64.69 
 
 		 511 aa  692    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  61.66 
 
 		 519 aa  648    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  60.66 
 
 		 565 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  60.98 
 
 		 515 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  60.31 
 
 		 512 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  58 
 
 		 537 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  61.73 
 
 		 523 aa  663    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  66.02 
 
 		 518 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  89.15 
 
 		 516 aa  963    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  64.33 
 
 		 526 aa  678    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  65.5 
 
 		 514 aa  707    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  60 
 
 		 520 aa  634    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  60.51 
 
 		 530 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  59.45 
 
 		 511 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  60.19 
 
 		 518 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  58.06 
 
 		 528 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  59.62 
 
 		 520 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  57.64 
 
 		 517 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  57.95 
 
 		 525 aa  633  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  55.68 
 
 		 540 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  59.22 
 
 		 513 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  59.34 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  57.85 
 
 		 526 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>