More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3485 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  71.62 
 
 
525 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  71.62 
 
 
525 aa  791    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1422  GMP synthase  65.04 
 
 
535 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1030  GMP synthase  92.57 
 
 
525 aa  1000    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  66.67 
 
 
520 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1032  GMP synthase  92.76 
 
 
525 aa  1001    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  67.22 
 
 
540 aa  714    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  66.48 
 
 
540 aa  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2402  GMP synthase  66.23 
 
 
539 aa  711    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.630699  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  73.95 
 
 
524 aa  791    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1431  GMP synthase  65.31 
 
 
547 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00571837  normal  0.0960661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  69.98 
 
 
525 aa  773    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  72.19 
 
 
525 aa  794    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  67.41 
 
 
532 aa  718    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  66.48 
 
 
520 aa  716    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  71.62 
 
 
525 aa  791    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  70.55 
 
 
525 aa  774    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1450  GMP synthase  91.43 
 
 
525 aa  996    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0677657  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  70.24 
 
 
532 aa  775    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  69.9 
 
 
517 aa  768    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.9 
 
 
516 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  78.67 
 
 
525 aa  862    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1522  GMP synthase  66.23 
 
 
539 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.403543  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  66.22 
 
 
525 aa  729    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  66.22 
 
 
525 aa  729    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1262  GMP synthase  91.62 
 
 
525 aa  1000    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  70.78 
 
 
536 aa  771    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2337  GMP synthase  65.25 
 
 
544 aa  697    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2949  GMP synthase  70.72 
 
 
526 aa  780    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  77.33 
 
 
525 aa  838    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1854  GMP synthase  66.79 
 
 
539 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  70.46 
 
 
520 aa  753    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  69.98 
 
 
525 aa  773    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1891  GMP synthase  66.23 
 
 
539 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.888833  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2546  GMP synthase  66.04 
 
 
547 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  71.26 
 
 
524 aa  764    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4587  GMP synthase  90.86 
 
 
525 aa  992    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2454  GMP synthase  66.23 
 
 
539 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  64.38 
 
 
520 aa  693    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5299  GMP synthase  65.49 
 
 
539 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2021  GMP synthase  66.23 
 
 
539 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1622  GMP synthase  68.74 
 
 
534 aa  724    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661733  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  70.55 
 
 
525 aa  775    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3290  GMP synthase  66.23 
 
 
539 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0624455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  66.67 
 
 
520 aa  713    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  88.76 
 
 
527 aa  968    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1615  GMP synthase  72.66 
 
 
526 aa  779    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.25634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  69.52 
 
 
525 aa  768    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  100 
 
 
525 aa  1076    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  70.94 
 
 
525 aa  777    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  70.67 
 
 
525 aa  787    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  67.57 
 
 
522 aa  726    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  70.48 
 
 
525 aa  780    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  69.47 
 
 
525 aa  766    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2058  GMP synthase  66.42 
 
 
599 aa  713    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  69.98 
 
 
525 aa  770    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  65.67 
 
 
539 aa  682    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  69.98 
 
 
525 aa  773    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  69.71 
 
 
525 aa  769    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  69.79 
 
 
525 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2287  GMP synthase  66.85 
 
 
536 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  78.54 
 
 
542 aa  854    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  92.76 
 
 
525 aa  1002    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  69.08 
 
 
526 aa  747    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  65.86 
 
 
539 aa  706    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  67.18 
 
 
527 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  69.02 
 
 
525 aa  763    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  62.1 
 
 
524 aa  683    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  77.44 
 
 
525 aa  833    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  66.79 
 
 
539 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0016  GMP synthase  69.83 
 
 
531 aa  763    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0584814  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1463  GMP synthase  66.6 
 
 
539 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160024  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0650  GMP synthase  59.77 
 
 
526 aa  664    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.331124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  72.22 
 
 
529 aa  780    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  67.59 
 
 
538 aa  713    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  69.14 
 
 
517 aa  763    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  68 
 
 
522 aa  733    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6088  GMP synthase  65.49 
 
 
539 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1072  GMP synthase  92.95 
 
 
525 aa  1002    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  72.57 
 
 
525 aa  792    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  71.62 
 
 
525 aa  790    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  62.29 
 
 
524 aa  685    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  71.62 
 
 
525 aa  791    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0530  GMP synthase  65.6 
 
 
535 aa  699    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  69.52 
 
 
523 aa  761    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1292  GMP synthase  66.23 
 
 
539 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  70.94 
 
 
525 aa  776    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  70.75 
 
 
525 aa  775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  74.48 
 
 
525 aa  789    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  69.02 
 
 
525 aa  765    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  71.62 
 
 
525 aa  791    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2009  GMP synthase  65.49 
 
 
539 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2022  GMP synthase  66.23 
 
 
539 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  88.19 
 
 
525 aa  964    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  67.66 
 
 
541 aa  719    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  70.94 
 
 
525 aa  776    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  69.71 
 
 
525 aa  769    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  69.6 
 
 
525 aa  769    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1989  GMP synthase  65.49 
 
 
539 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  64.95 
 
 
533 aa  689    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>