More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1321 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  73.51 
 
 		 534 aa  780    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  61.09 
 
 		 516 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  67.96 
 
 		 528 aa  715    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  73.79 
 
 		 521 aa  787    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  71.21 
 
 		 520 aa  779    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  70.82 
 
 		 523 aa  778    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  73.52 
 
 		 526 aa  787    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  71.4 
 
 		 520 aa  785    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  67.05 
 
 		 519 aa  721    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  73.8 
 
 		 565 aa  801    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  68.09 
 
 		 518 aa  720    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  70.96 
 
 		 533 aa  756    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  70.82 
 
 		 518 aa  770    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1587  GMP synthase  68.09 
 
 		 520 aa  721    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0923509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  74.9 
 
 		 535 aa  803    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  100 
 
 		 530 aa  1085    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  68.09 
 
 		 518 aa  720    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  72.96 
 
 		 520 aa  794    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  74.39 
 
 		 534 aa  824    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  74.37 
 
 		 518 aa  792    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  72.67 
 
 		 525 aa  769    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  74.19 
 
 		 540 aa  793    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  83.75 
 
 		 540 aa  897    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  71.21 
 
 		 520 aa  780    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  64.49 
 
 		 535 aa  694    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  72.18 
 
 		 520 aa  790    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  72.99 
 
 		 535 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  74.37 
 
 		 556 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  74.95 
 
 		 518 aa  786    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  71.56 
 
 		 540 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  75.53 
 
 		 518 aa  793    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  61.28 
 
 		 516 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  74.17 
 
 		 524 aa  792    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  65.76 
 
 		 520 aa  709    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  79.05 
 
 		 537 aa  857    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  70.13 
 
 		 541 aa  757    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  72.96 
 
 		 519 aa  794    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  73.93 
 
 		 520 aa  775    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  60.51 
 
 		 516 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  74.17 
 
 		 521 aa  792    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  71.48 
 
 		 519 aa  761    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  67.89 
 
 		 518 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  74.17 
 
 		 521 aa  790    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  61.48 
 
 		 517 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  72.37 
 
 		 520 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  61.55 
 
 		 514 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  61.55 
 
 		 514 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  61.97 
 
 		 518 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  61.97 
 
 		 518 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  60.31 
 
 		 518 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  61.97 
 
 		 518 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  60.42 
 
 		 518 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  59.89 
 
 		 522 aa  615  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  60.78 
 
 		 512 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  60.58 
 
 		 512 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  57.48 
 
 		 511 aa  608  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  56.3 
 
 		 525 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  57.69 
 
 		 522 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  57.31 
 
 		 527 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  57.64 
 
 		 525 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  57.64 
 
 		 525 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  57.64 
 
 		 525 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  59.03 
 
 		 520 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  57.64 
 
 		 525 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  57.06 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  57.45 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  57.45 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.89 
 
 		 510 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  56.87 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  57.45 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  57.45 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  57.45 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  57.64 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  57.39 
 
 		 527 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  57.45 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  57.45 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  56.3 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  57.45 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  57.64 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  56.68 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  56.49 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  56.42 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  57.45 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  56.68 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  55.73 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  55.92 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  59.03 
 
 		 520 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  55.73 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  57.06 
 
 		 525 aa  598  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  55.73 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  56.67 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  55.73 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  57.2 
 
 		 527 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  56.87 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  56.37 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  57.12 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  57.25 
 
 		 525 aa  598  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  57.88 
 
 		 521 aa  592  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  57 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  55.79 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>