More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1793 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  60.39 
 
 
514 aa  649    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  58.95 
 
 
516 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  100 
 
 
515 aa  1063    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  60.62 
 
 
511 aa  640    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  60.12 
 
 
517 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  58.17 
 
 
516 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  57.78 
 
 
516 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  58.33 
 
 
518 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  58.53 
 
 
518 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  57.5 
 
 
515 aa  621  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  58.53 
 
 
518 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  58.53 
 
 
518 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  58.53 
 
 
510 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  58.71 
 
 
516 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  57.28 
 
 
513 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  56.48 
 
 
518 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  57.8 
 
 
511 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  58.49 
 
 
525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  57.78 
 
 
533 aa  598  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  57.39 
 
 
513 aa  598  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.36 
 
 
513 aa  599  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  57.56 
 
 
514 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  57.56 
 
 
514 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.35 
 
 
522 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  54.99 
 
 
511 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54.72 
 
 
515 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.92 
 
 
512 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  55.3 
 
 
515 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.4 
 
 
510 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  57.12 
 
 
512 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  57 
 
 
560 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  57 
 
 
560 aa  591  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  56.21 
 
 
513 aa  591  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.27 
 
 
509 aa  588  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  55.53 
 
 
518 aa  588  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  54.67 
 
 
513 aa  585  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  54.81 
 
 
528 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  56.41 
 
 
513 aa  585  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  54.81 
 
 
528 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  56.09 
 
 
511 aa  588  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  55.32 
 
 
511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  54.62 
 
 
516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  55.43 
 
 
523 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  55.97 
 
 
509 aa  578  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.77 
 
 
542 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  54.81 
 
 
548 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.77 
 
 
542 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.68 
 
 
510 aa  579  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  56.95 
 
 
506 aa  579  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  56.41 
 
 
513 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  54.14 
 
 
515 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  54.84 
 
 
520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  55.04 
 
 
520 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  53.54 
 
 
540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  54.56 
 
 
528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.96 
 
 
575 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  54.42 
 
 
528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  55.23 
 
 
531 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  55.08 
 
 
515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  53.67 
 
 
537 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  53.29 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  56.26 
 
 
518 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  54.21 
 
 
525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  55.51 
 
 
556 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.13 
 
 
510 aa  571  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  54.74 
 
 
565 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  54.81 
 
 
525 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  54.04 
 
 
525 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.16 
 
 
511 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  54.76 
 
 
535 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  54.62 
 
 
528 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  56.12 
 
 
518 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  54.41 
 
 
514 aa  571  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  51.63 
 
 
542 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  54.84 
 
 
540 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  52.96 
 
 
509 aa  570  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  53.14 
 
 
575 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  54.84 
 
 
510 aa  569  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  55.23 
 
 
517 aa  568  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  53.74 
 
 
520 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  55.51 
 
 
528 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.23 
 
 
525 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  54.21 
 
 
518 aa  571  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  54.04 
 
 
520 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  56.16 
 
 
510 aa  568  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  53.2 
 
 
512 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  53.97 
 
 
520 aa  565  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  54.05 
 
 
520 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  55.45 
 
 
510 aa  566  1e-160  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  54.62 
 
 
525 aa  565  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  54.98 
 
 
526 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  54.93 
 
 
519 aa  567  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  53.49 
 
 
511 aa  568  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  55.13 
 
 
514 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  56.12 
 
 
541 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  53.88 
 
 
520 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  54.76 
 
 
534 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  54.23 
 
 
525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  53.6 
 
 
526 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.32 
 
 
512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>