More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0934 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  75.98 
 
 		 510 aa  807    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  64.24 
 
 		 506 aa  696    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  68.18 
 
 		 515 aa  715    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  71.91 
 
 		 509 aa  743    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  69.35 
 
 		 509 aa  724    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  73.67 
 
 		 508 aa  796    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  74.07 
 
 		 509 aa  796    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  100 
 
 		 509 aa  1042    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  68.75 
 
 		 512 aa  729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  55.64 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  56.95 
 
 		 516 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.34 
 
 		 516 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  56.75 
 
 		 516 aa  598  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.84 
 
 		 511 aa  595  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  55.13 
 
 		 517 aa  596  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  56.01 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  55.64 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  56.4 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  55.62 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  54.97 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  56.02 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  54.99 
 
 		 518 aa  586  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  55.81 
 
 		 513 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  54.51 
 
 		 514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  56.56 
 
 		 511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  54.95 
 
 		 514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  54.84 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  54.84 
 
 		 514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  55.45 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.25 
 
 		 520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  55.15 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  54.14 
 
 		 518 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  53.07 
 
 		 522 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  52.96 
 
 		 515 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  53.98 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  54.16 
 
 		 521 aa  565  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  53.79 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  54.16 
 
 		 521 aa  568  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  53.42 
 
 		 517 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  53.97 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  53.97 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  54.09 
 
 		 520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.97 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  53.97 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  53.77 
 
 		 525 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  53.82 
 
 		 517 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.97 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.01 
 
 		 517 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  53.51 
 
 		 526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  54.09 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.97 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.97 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.69 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  53.58 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  52.45 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  53.58 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  53.58 
 
 		 525 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  53.58 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  53.2 
 
 		 518 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  54.84 
 
 		 515 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  53.58 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  53.65 
 
 		 525 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  53.58 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  52.79 
 
 		 527 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  53.86 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  52.13 
 
 		 522 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  52.33 
 
 		 522 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  53.12 
 
 		 527 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  52.46 
 
 		 509 aa  555  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  53.12 
 
 		 517 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  53.89 
 
 		 520 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  53.03 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1450  GMP synthase  52.99 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0677657  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  52.22 
 
 		 523 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  52.12 
 
 		 525 aa  552  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  52.12 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  51.92 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  52.65 
 
 		 527 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  54.49 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  51.37 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  53.12 
 
 		 511 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  52.9 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  52.7 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  52.8 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  51.17 
 
 		 513 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  52.6 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  53.18 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1262  GMP synthase  52.6 
 
 		 525 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  52.22 
 
 		 525 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  53.18 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  50.68 
 
 		 542 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  53.18 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  53.09 
 
 		 525 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  53.18 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  52.79 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  51.74 
 
 		 525 aa  548  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  53 
 
 		 523 aa  551  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  52.36 
 
 		 527 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  52.9 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  53.1 
 
 		 533 aa  551  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>