More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6854 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0589  GMP synthase  62.5 
 
 		 506 aa  657    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  63.65 
 
 		 515 aa  655    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  67.77 
 
 		 509 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  64.45 
 
 		 509 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  67.19 
 
 		 508 aa  706    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  68.75 
 
 		 509 aa  729    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  100 
 
 		 512 aa  1055    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  69.4 
 
 		 510 aa  721    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  66.6 
 
 		 509 aa  689    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.33 
 
 		 522 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  57.12 
 
 		 511 aa  595  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  57.69 
 
 		 518 aa  591  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  57.56 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  58.14 
 
 		 513 aa  585  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  57.28 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  56.42 
 
 		 518 aa  586  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  58.06 
 
 		 513 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  56.48 
 
 		 520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  54.89 
 
 		 517 aa  579  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  56.31 
 
 		 513 aa  581  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.23 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  56.87 
 
 		 520 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.45 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  56.4 
 
 		 520 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  56.76 
 
 		 523 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.45 
 
 		 516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  56.31 
 
 		 514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  55.13 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  55.81 
 
 		 520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  55.21 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  55.79 
 
 		 518 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  55.85 
 
 		 520 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  55.85 
 
 		 520 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  55.41 
 
 		 514 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.67 
 
 		 511 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  55.56 
 
 		 556 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  55.41 
 
 		 514 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  55.75 
 
 		 535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  54.44 
 
 		 518 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  55.34 
 
 		 534 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  54.98 
 
 		 565 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  55.09 
 
 		 526 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  53.9 
 
 		 521 aa  555  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  54.89 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  53.4 
 
 		 511 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  55.79 
 
 		 518 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  55.56 
 
 		 533 aa  557  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  54.48 
 
 		 540 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54.23 
 
 		 515 aa  558  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.56 
 
 		 509 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.56 
 
 		 509 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  53.26 
 
 		 575 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  53.9 
 
 		 521 aa  552  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  54 
 
 		 513 aa  552  1e-156  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  54.37 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  55.41 
 
 		 518 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  53.7 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  55.02 
 
 		 518 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  53.42 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  53.42 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.42 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.42 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.42 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  53.29 
 
 		 520 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  55.13 
 
 		 530 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  53.42 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  52.96 
 
 		 529 aa  548  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.42 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  53.41 
 
 		 514 aa  548  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  53.54 
 
 		 525 aa  548  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  52.9 
 
 		 515 aa  551  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  53.79 
 
 		 515 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  52.94 
 
 		 525 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  55.43 
 
 		 518 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  54.51 
 
 		 519 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  52.86 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  53.67 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  52.67 
 
 		 520 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  53.04 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  53.41 
 
 		 512 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  52.88 
 
 		 517 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  52.87 
 
 		 525 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  52.87 
 
 		 525 aa  548  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  53.23 
 
 		 525 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.08 
 
 		 517 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  53.04 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  53.04 
 
 		 525 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  53.04 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  53.04 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  54.65 
 
 		 528 aa  548  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  53.92 
 
 		 519 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  52.41 
 
 		 537 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  55.62 
 
 		 518 aa  548  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  53.95 
 
 		 519 aa  547  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  52.75 
 
 		 525 aa  548  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.01 
 
 		 525 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  55.02 
 
 		 520 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  55.17 
 
 		 540 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  53.15 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  54.41 
 
 		 535 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>