More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0993 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0589  GMP synthase  63.26 
 
 		 506 aa  690    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  73.77 
 
 		 510 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  67.19 
 
 		 512 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  71.51 
 
 		 509 aa  761    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  100 
 
 		 508 aa  1048    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  69.57 
 
 		 515 aa  740    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  69.94 
 
 		 509 aa  760    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  73.67 
 
 		 509 aa  796    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  72.1 
 
 		 509 aa  779    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.02 
 
 		 522 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.67 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.42 
 
 		 516 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  57.31 
 
 		 514 aa  600  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  57 
 
 		 512 aa  596  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  57.06 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  56.67 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  56.95 
 
 		 518 aa  597  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  57.39 
 
 		 511 aa  589  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  56.67 
 
 		 513 aa  585  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  56.37 
 
 		 513 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  55.86 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  55.13 
 
 		 513 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  56.45 
 
 		 516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  55.17 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  54.58 
 
 		 517 aa  578  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  57.23 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  55.73 
 
 		 511 aa  581  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.95 
 
 		 520 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.97 
 
 		 517 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  55.98 
 
 		 513 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  55.06 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  55.19 
 
 		 518 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  55.41 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  55.41 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  55.73 
 
 		 515 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  55.81 
 
 		 514 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  55.41 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  55.81 
 
 		 514 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  55.36 
 
 		 520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  54.55 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  55.92 
 
 		 520 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  53.8 
 
 		 517 aa  568  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  54.55 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  54.35 
 
 		 525 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  55.02 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  54.91 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  54.55 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.79 
 
 		 511 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  56.36 
 
 		 515 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  54.35 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  54.62 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  54.46 
 
 		 521 aa  567  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  54.65 
 
 		 523 aa  567  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  55.17 
 
 		 520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  53.23 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  55.58 
 
 		 525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  54.53 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  54.63 
 
 		 525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  53.89 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  55.38 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  54.42 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54.47 
 
 		 515 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  54.25 
 
 		 527 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  55.58 
 
 		 525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  54.72 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  53.49 
 
 		 522 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  54.86 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  53.74 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  54.07 
 
 		 521 aa  561  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  53.37 
 
 		 525 aa  561  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  53.86 
 
 		 514 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  53.93 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  53.29 
 
 		 522 aa  560  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  54.63 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.71 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  54.05 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54.99 
 
 		 515 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  53.38 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  53.17 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  54.51 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  54.64 
 
 		 511 aa  558  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  54.86 
 
 		 523 aa  557  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  53.17 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  52.98 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  53.17 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  54.86 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  54.09 
 
 		 518 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  52.98 
 
 		 525 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  53.41 
 
 		 526 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  53.8 
 
 		 525 aa  552  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  54.86 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  54.09 
 
 		 518 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  52.78 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  52.98 
 
 		 525 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>