More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1861 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0589  GMP synthase  65.22 
 
 		 506 aa  690    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  100 
 
 		 515 aa  1061    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  63.65 
 
 		 512 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  69.37 
 
 		 510 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  78.02 
 
 		 509 aa  819    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  67.19 
 
 		 509 aa  707    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  68.18 
 
 		 509 aa  715    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  69.57 
 
 		 508 aa  740    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  77.51 
 
 		 509 aa  813    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  55.98 
 
 		 517 aa  595  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  57.98 
 
 		 513 aa  596  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  57.03 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  57.7 
 
 		 515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.4 
 
 		 514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  55.08 
 
 		 515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  55.66 
 
 		 518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  55.06 
 
 		 513 aa  571  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  55.15 
 
 		 514 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  55.3 
 
 		 518 aa  569  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  54.81 
 
 		 516 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  54.81 
 
 		 516 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  54.42 
 
 		 516 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  56.34 
 
 		 513 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  55.56 
 
 		 515 aa  561  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  55.06 
 
 		 513 aa  560  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  54.9 
 
 		 511 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.78 
 
 		 511 aa  557  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  54 
 
 		 516 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  55.06 
 
 		 528 aa  552  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  53.03 
 
 		 512 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  54.88 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  53.36 
 
 		 520 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  52.5 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  53.54 
 
 		 512 aa  547  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  53 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  53.54 
 
 		 511 aa  547  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54.1 
 
 		 515 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  54.1 
 
 		 520 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  53.91 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  52.99 
 
 		 519 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  53.36 
 
 		 520 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  53.32 
 
 		 523 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  52.24 
 
 		 517 aa  540  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.23 
 
 		 517 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  53.03 
 
 		 517 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  50.69 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  53 
 
 		 523 aa  540  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  52.69 
 
 		 533 aa  541  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  52.9 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  52.9 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  52.9 
 
 		 525 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.09 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  52.9 
 
 		 525 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  53.02 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.09 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  52.78 
 
 		 520 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.09 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  52.9 
 
 		 525 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  52.9 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.09 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  52.24 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  52.9 
 
 		 525 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  53.02 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  52.9 
 
 		 525 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  52.64 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  52.99 
 
 		 525 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  52.9 
 
 		 525 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  52.7 
 
 		 525 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  52.12 
 
 		 518 aa  533  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  51.61 
 
 		 527 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  51.64 
 
 		 525 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  51.28 
 
 		 511 aa  534  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  51.42 
 
 		 525 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  51.52 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  52.15 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  52.14 
 
 		 513 aa  531  1e-149  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  51.62 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  51.62 
 
 		 525 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  51.23 
 
 		 526 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  52.15 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  52.76 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  53.28 
 
 		 540 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  53.52 
 
 		 522 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  52.12 
 
 		 525 aa  531  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  52.23 
 
 		 525 aa  531  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  52.4 
 
 		 524 aa  527  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  51.25 
 
 		 525 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  51.46 
 
 		 522 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  53.41 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70121  GMP synthase  53.02 
 
 		 528 aa  528  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.0696406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  51.82 
 
 		 520 aa  525  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  51.65 
 
 		 522 aa  528  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0123  GMP synthase  53.7 
 
 		 526 aa  528  1e-148  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  53.8 
 
 		 556 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  52.6 
 
 		 524 aa  528  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  53.32 
 
 		 519 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  49.9 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  52.31 
 
 		 523 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  52.05 
 
 		 520 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  51.54 
 
 		 525 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>