More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl342 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  59.8 
 
 
512 aa  636    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  100 
 
 
513 aa  1054    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  60.04 
 
 
512 aa  634  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  53.15 
 
 
522 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.1 
 
 
511 aa  570  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  53.79 
 
 
512 aa  568  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  51.43 
 
 
536 aa  565  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  51.99 
 
 
532 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  54.51 
 
 
517 aa  567  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  53.1 
 
 
514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  52.31 
 
 
525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  54.4 
 
 
507 aa  561  1.0000000000000001e-159  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  52.33 
 
 
517 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  52.76 
 
 
521 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  54.51 
 
 
517 aa  558  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  54.09 
 
 
510 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  53.68 
 
 
511 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0016  GMP synthase  50.67 
 
 
531 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0584814  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  52.52 
 
 
517 aa  555  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  52.24 
 
 
512 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  52.88 
 
 
520 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  53.7 
 
 
511 aa  555  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  51.82 
 
 
523 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  51.94 
 
 
537 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  53.32 
 
 
540 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  52.04 
 
 
518 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  54 
 
 
512 aa  552  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  52.14 
 
 
516 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  51.81 
 
 
527 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  51.81 
 
 
527 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.88 
 
 
511 aa  554  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  51.71 
 
 
525 aa  551  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  52.62 
 
 
511 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.65 
 
 
517 aa  548  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  51.46 
 
 
512 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  51.91 
 
 
525 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  51.94 
 
 
517 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  51.55 
 
 
525 aa  550  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  53.1 
 
 
513 aa  551  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  52.51 
 
 
516 aa  548  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  51.25 
 
 
575 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0610  GMP synthase  52.6 
 
 
528 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.558276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  52.46 
 
 
526 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  51.54 
 
 
521 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  51.46 
 
 
515 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  51.46 
 
 
512 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  51.27 
 
 
512 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  51.07 
 
 
510 aa  547  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  50.95 
 
 
525 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  52.85 
 
 
513 aa  548  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  51.72 
 
 
525 aa  547  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  51.27 
 
 
515 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  51.67 
 
 
515 aa  548  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  51.27 
 
 
515 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  51.43 
 
 
525 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0530  GMP synthase  51.59 
 
 
535 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  51.67 
 
 
512 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  51.67 
 
 
512 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  53.47 
 
 
514 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  51.26 
 
 
520 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  51.67 
 
 
512 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  52.43 
 
 
511 aa  545  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  52.85 
 
 
513 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  51.07 
 
 
512 aa  545  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  52.34 
 
 
517 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  52.5 
 
 
525 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2764  GMP synthase  52.95 
 
 
539 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  51.87 
 
 
509 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  50.67 
 
 
525 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  51.54 
 
 
525 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  52.42 
 
 
519 aa  545  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  52.8 
 
 
513 aa  545  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  52.85 
 
 
513 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  51.44 
 
 
528 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  51.44 
 
 
528 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  51.07 
 
 
520 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  51.24 
 
 
527 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  51.47 
 
 
541 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  50 
 
 
510 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  52.49 
 
 
525 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  51.57 
 
 
509 aa  542  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  51.24 
 
 
525 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  51.25 
 
 
528 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  51.83 
 
 
525 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  51.06 
 
 
520 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  51.35 
 
 
525 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  53.14 
 
 
508 aa  542  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  51.74 
 
 
526 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  53.02 
 
 
524 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  51.24 
 
 
542 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  51.64 
 
 
525 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  52.06 
 
 
509 aa  545  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  52.21 
 
 
523 aa  544  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  51.06 
 
 
575 aa  544  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  52.42 
 
 
518 aa  542  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  52.21 
 
 
538 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  50.19 
 
 
516 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  50.38 
 
 
533 aa  544  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  51.16 
 
 
520 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  51.64 
 
 
525 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>