More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0009 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  61.13 
 
 		 525 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  61.13 
 
 		 525 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  84.12 
 
 		 532 aa  938    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  60.8 
 
 		 520 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1032  GMP synthase  70.02 
 
 		 525 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  60.19 
 
 		 525 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  64.52 
 
 		 524 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  60.94 
 
 		 525 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  61.21 
 
 		 527 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  61.86 
 
 		 525 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  61.13 
 
 		 525 aa  683    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  70.78 
 
 		 525 aa  771    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  59.81 
 
 		 517 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  61.74 
 
 		 525 aa  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1450  GMP synthase  69.45 
 
 		 525 aa  756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0677657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  61.36 
 
 		 525 aa  676    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  61.71 
 
 		 517 aa  686    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  70.21 
 
 		 525 aa  767    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  61.13 
 
 		 525 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  65.09 
 
 		 523 aa  714    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  60.61 
 
 		 525 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  60.61 
 
 		 525 aa  661    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1262  GMP synthase  69.07 
 
 		 525 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  100 
 
 		 536 aa  1102    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2337  GMP synthase  58.91 
 
 		 544 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1030  GMP synthase  69.83 
 
 		 525 aa  762    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  61.13 
 
 		 525 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  61.38 
 
 		 520 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  60.75 
 
 		 525 aa  661    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  62.12 
 
 		 525 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  61.13 
 
 		 525 aa  682    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  62.33 
 
 		 524 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4587  GMP synthase  68.69 
 
 		 525 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  59.58 
 
 		 520 aa  639    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  62.4 
 
 		 521 aa  674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  62.12 
 
 		 525 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  59.52 
 
 		 541 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1622  GMP synthase  60.53 
 
 		 534 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661733  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  61.38 
 
 		 520 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  61.13 
 
 		 525 aa  682    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1615  GMP synthase  65.65 
 
 		 526 aa  700    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.25634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  69.07 
 
 		 525 aa  748    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  62.12 
 
 		 525 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  61.22 
 
 		 540 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  59.39 
 
 		 522 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  61.13 
 
 		 525 aa  683    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  61.13 
 
 		 525 aa  683    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2764  GMP synthase  59.55 
 
 		 539 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  60.94 
 
 		 525 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  61.93 
 
 		 525 aa  677    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  60.94 
 
 		 525 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  61.55 
 
 		 525 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  62.62 
 
 		 529 aa  684    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  60.94 
 
 		 525 aa  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  66.85 
 
 		 542 aa  738    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  60.48 
 
 		 538 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  59.89 
 
 		 526 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  58.81 
 
 		 539 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  60.83 
 
 		 527 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  60.8 
 
 		 525 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  61.93 
 
 		 525 aa  678    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  67.42 
 
 		 525 aa  721    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1072  GMP synthase  70.21 
 
 		 525 aa  763    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0016  GMP synthase  96.99 
 
 		 531 aa  1067    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0584814  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  61.32 
 
 		 525 aa  682    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  61.13 
 
 		 525 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  61.17 
 
 		 525 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  60.57 
 
 		 517 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  62.6 
 
 		 521 aa  679    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  58.06 
 
 		 524 aa  634    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  62.26 
 
 		 525 aa  688    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  69.83 
 
 		 526 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  59.96 
 
 		 521 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  60.94 
 
 		 525 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  58.25 
 
 		 524 aa  637    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  61.03 
 
 		 523 aa  680    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  61.13 
 
 		 525 aa  683    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  61.74 
 
 		 525 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  61.55 
 
 		 525 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  66.04 
 
 		 525 aa  716    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  61.36 
 
 		 525 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  61.02 
 
 		 527 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0530  GMP synthase  60.67 
 
 		 535 aa  660    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  61.13 
 
 		 525 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  69.83 
 
 		 525 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1422  GMP synthase  59.93 
 
 		 535 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  60.85 
 
 		 538 aa  653    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  61.29 
 
 		 522 aa  660    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  69.64 
 
 		 527 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  59.26 
 
 		 540 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  60.94 
 
 		 525 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  61.1 
 
 		 522 aa  658    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  58.99 
 
 		 533 aa  648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  61.74 
 
 		 525 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  61.93 
 
 		 525 aa  679    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  60.61 
 
 		 520 aa  641    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  61.51 
 
 		 525 aa  682    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  59.85 
 
 		 525 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2949  GMP synthase  62.12 
 
 		 526 aa  676    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  66.22 
 
 		 525 aa  712    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>