More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0315 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  83.07 
 
 		 513 aa  887    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  85.02 
 
 		 513 aa  897    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  80.54 
 
 		 511 aa  867    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  88.72 
 
 		 514 aa  940    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  100 
 
 		 518 aa  1057    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  84.44 
 
 		 513 aa  897    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  83.46 
 
 		 513 aa  887    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.9 
 
 		 522 aa  615  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  57.03 
 
 		 511 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  57.23 
 
 		 518 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.87 
 
 		 516 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  55.98 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.71 
 
 		 516 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  58.95 
 
 		 507 aa  601  1e-170  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  57.09 
 
 		 515 aa  601  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.32 
 
 		 516 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.75 
 
 		 514 aa  595  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  56.2 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  55.53 
 
 		 515 aa  588  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  56.56 
 
 		 509 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  57.69 
 
 		 512 aa  591  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  55.45 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  56.01 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  56.02 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  55.43 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  56.07 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  55.23 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  55.43 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  56.09 
 
 		 509 aa  578  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  55.21 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  57.14 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  55.19 
 
 		 508 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54.39 
 
 		 515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  55.17 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.26 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  55.51 
 
 		 515 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  56.62 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  54.98 
 
 		 518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  55.66 
 
 		 515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  54.35 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  55.13 
 
 		 509 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  54.91 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  53.86 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.65 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  54.35 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.9 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  53.88 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  55.26 
 
 		 513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70121  GMP synthase  54.96 
 
 		 528 aa  572  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.0696406 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  54.84 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  55.36 
 
 		 518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  55.41 
 
 		 520 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  55.6 
 
 		 526 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  53.67 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  55.79 
 
 		 516 aa  571  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  54.98 
 
 		 518 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  55.75 
 
 		 519 aa  570  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.1 
 
 		 525 aa  569  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  54.46 
 
 		 511 aa  568  1e-160  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  55.77 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  53.32 
 
 		 520 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  55.41 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  55.3 
 
 		 517 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  53.86 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  53.47 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  54.08 
 
 		 525 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  52.8 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  54.11 
 
 		 524 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  53.19 
 
 		 520 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  53.26 
 
 		 522 aa  558  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  53.9 
 
 		 528 aa  558  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  55.21 
 
 		 510 aa  559  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  53.65 
 
 		 535 aa  558  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  53.88 
 
 		 524 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  54.25 
 
 		 520 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  52.61 
 
 		 512 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  53.77 
 
 		 520 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  55.11 
 
 		 525 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  55.11 
 
 		 525 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  54.92 
 
 		 525 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  55.11 
 
 		 525 aa  561  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  54.44 
 
 		 520 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  54.92 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  54.92 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  54.53 
 
 		 517 aa  557  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  54.48 
 
 		 525 aa  558  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.53 
 
 		 517 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  52.9 
 
 		 510 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  52.22 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  54.92 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  54.92 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  52.61 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  52.88 
 
 		 518 aa  555  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  54.92 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  54.42 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  53.64 
 
 		 556 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  53.22 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  54.62 
 
 		 518 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  54.36 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  53.18 
 
 		 533 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>