More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0192 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  100 
 
 		 512 aa  1049    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  59.22 
 
 		 517 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  58.24 
 
 		 516 aa  623  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  57.84 
 
 		 516 aa  618  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  59.1 
 
 		 518 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  57.84 
 
 		 516 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.45 
 
 		 511 aa  610  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  56.84 
 
 		 516 aa  605  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  57.2 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  54.9 
 
 		 510 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  56.7 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  56.7 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  56.67 
 
 		 515 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  57.36 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.12 
 
 		 509 aa  594  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  54.69 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  55.88 
 
 		 515 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  56.81 
 
 		 518 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.46 
 
 		 522 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  56.25 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  54.67 
 
 		 537 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.31 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.3 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.71 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  56.61 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  56.53 
 
 		 525 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  53.29 
 
 		 540 aa  585  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.71 
 
 		 515 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  56.61 
 
 		 518 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  53.4 
 
 		 528 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  55.4 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  54.71 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  57.14 
 
 		 526 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.81 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  55.88 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  55.01 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  54.31 
 
 		 515 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  54.31 
 
 		 515 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  53.59 
 
 		 528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.31 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  55.49 
 
 		 515 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  54.31 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  55.69 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  54.31 
 
 		 515 aa  581  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  55.21 
 
 		 517 aa  579  1e-164  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.71 
 
 		 512 aa  581  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  54.01 
 
 		 516 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  55.19 
 
 		 513 aa  578  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  55.02 
 
 		 521 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  55.43 
 
 		 524 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  55.31 
 
 		 506 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  52.33 
 
 		 575 aa  575  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  55.1 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  52.71 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  54.01 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.71 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.4 
 
 		 510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  54.91 
 
 		 518 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  52.82 
 
 		 528 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  56.14 
 
 		 520 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  53.8 
 
 		 516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.71 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.52 
 
 		 575 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  52.91 
 
 		 542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  56.05 
 
 		 512 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  54.08 
 
 		 527 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  55.11 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  54.08 
 
 		 527 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.82 
 
 		 511 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  54.51 
 
 		 513 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  54.62 
 
 		 517 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  55.95 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  55.79 
 
 		 513 aa  571  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  55.95 
 
 		 533 aa  570  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  54.01 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  53.53 
 
 		 517 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  55.68 
 
 		 513 aa  571  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  53.53 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  55.02 
 
 		 513 aa  569  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  53.59 
 
 		 523 aa  568  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  54.51 
 
 		 519 aa  568  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  54.99 
 
 		 534 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  55.75 
 
 		 520 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  52.82 
 
 		 528 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  52.82 
 
 		 528 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  56.95 
 
 		 535 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  51.55 
 
 		 548 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  54.04 
 
 		 522 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  54.58 
 
 		 525 aa  568  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  56.53 
 
 		 556 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  54.34 
 
 		 537 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  51.95 
 
 		 509 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  52.15 
 
 		 509 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  53.54 
 
 		 511 aa  565  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  54.69 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  55.64 
 
 		 530 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  54.78 
 
 		 520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.55 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  53.14 
 
 		 517 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  53.23 
 
 		 526 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>