More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0422 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  70.74 
 
 
511 aa  769    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  63.76 
 
 
511 aa  682    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  64.34 
 
 
511 aa  691    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  67.51 
 
 
510 aa  707    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  100 
 
 
516 aa  1061    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  67.32 
 
 
510 aa  694    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  64.92 
 
 
511 aa  693    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  66.09 
 
 
511 aa  703    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  60.27 
 
 
511 aa  642    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  66.67 
 
 
510 aa  703    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  64.53 
 
 
511 aa  690    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  58.32 
 
 
514 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  58.32 
 
 
514 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  57.93 
 
 
517 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  58.71 
 
 
510 aa  611  9.999999999999999e-175  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  57.48 
 
 
518 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  58.32 
 
 
514 aa  610  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.93 
 
 
516 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  57.62 
 
 
518 aa  608  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  57.28 
 
 
518 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  57.28 
 
 
518 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  56.2 
 
 
518 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  56.16 
 
 
516 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.77 
 
 
516 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  57.56 
 
 
513 aa  594  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  57.75 
 
 
511 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  57.45 
 
 
514 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  54.88 
 
 
512 aa  588  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  56.73 
 
 
533 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  56.98 
 
 
513 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  56.31 
 
 
518 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.47 
 
 
509 aa  586  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  55.38 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  56.37 
 
 
513 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  56.16 
 
 
511 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  54.21 
 
 
513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  55.92 
 
 
518 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  54.93 
 
 
526 aa  581  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.1 
 
 
512 aa  579  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  53.91 
 
 
515 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  53.91 
 
 
515 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  56.4 
 
 
513 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  53.91 
 
 
515 aa  579  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  54.79 
 
 
513 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  55.56 
 
 
515 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  53.88 
 
 
510 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  53.91 
 
 
512 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  55.23 
 
 
510 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  55.73 
 
 
518 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  55.32 
 
 
511 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  53.91 
 
 
512 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  54.21 
 
 
513 aa  579  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  56.59 
 
 
513 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  52.9 
 
 
542 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  54.17 
 
 
535 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  54.67 
 
 
516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  55.15 
 
 
521 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.79 
 
 
516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  54.95 
 
 
521 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  55.15 
 
 
521 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  54.79 
 
 
512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  55.27 
 
 
517 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  53.71 
 
 
512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  54.4 
 
 
513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  53.71 
 
 
515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  53.71 
 
 
512 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  54.4 
 
 
513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  54.76 
 
 
530 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  55.32 
 
 
525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  54.37 
 
 
528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  53.28 
 
 
537 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  55.32 
 
 
513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  53.88 
 
 
510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  53.62 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  53.42 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.71 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  53.8 
 
 
512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  55.04 
 
 
519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  53.71 
 
 
512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  54.35 
 
 
511 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  54.16 
 
 
515 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  55.04 
 
 
527 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  54.69 
 
 
517 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  54.4 
 
 
513 aa  571  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.32 
 
 
542 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.32 
 
 
542 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  55.34 
 
 
520 aa  571  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  55.27 
 
 
517 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  54.81 
 
 
520 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.06 
 
 
520 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  55.79 
 
 
518 aa  571  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  55.2 
 
 
525 aa  568  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  54.04 
 
 
540 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  53.79 
 
 
534 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  54.17 
 
 
541 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  55.04 
 
 
525 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  54.46 
 
 
526 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  54.37 
 
 
526 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  53.79 
 
 
556 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  53.4 
 
 
565 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>