More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00371 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  85.77 
 
 
528 aa  932    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  85.58 
 
 
528 aa  930    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  74.95 
 
 
540 aa  811    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  84.23 
 
 
528 aa  920    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  83.88 
 
 
528 aa  921    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  73.81 
 
 
528 aa  826    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  78.83 
 
 
575 aa  845    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  73.24 
 
 
542 aa  813    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  72.59 
 
 
542 aa  810    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  58.83 
 
 
510 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  73.14 
 
 
528 aa  821    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  73.81 
 
 
528 aa  827    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  74.24 
 
 
575 aa  819    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  74.76 
 
 
540 aa  805    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  74.67 
 
 
537 aa  816    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  100 
 
 
548 aa  1130    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  85.39 
 
 
528 aa  945    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  72.59 
 
 
542 aa  810    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  73.81 
 
 
528 aa  828    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.07 
 
 
517 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  58.25 
 
 
510 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  56.45 
 
 
516 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  56.26 
 
 
516 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  55.88 
 
 
516 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  55.92 
 
 
513 aa  608  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  55.36 
 
 
516 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  56.12 
 
 
513 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.59 
 
 
510 aa  592  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  54.77 
 
 
515 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  54.77 
 
 
515 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  54.77 
 
 
515 aa  589  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.11 
 
 
510 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  55.09 
 
 
512 aa  588  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  55.19 
 
 
512 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  56.09 
 
 
560 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.32 
 
 
512 aa  586  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.58 
 
 
515 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.73 
 
 
511 aa  586  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  55.62 
 
 
509 aa  585  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.62 
 
 
512 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  54.62 
 
 
512 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  55.32 
 
 
533 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.26 
 
 
511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  54.04 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.23 
 
 
512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  55.04 
 
 
518 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  55.04 
 
 
511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  54.76 
 
 
510 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  53.85 
 
 
512 aa  578  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  55.73 
 
 
534 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  55.13 
 
 
560 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54.81 
 
 
515 aa  579  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  54.76 
 
 
513 aa  581  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  53.01 
 
 
512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  53.2 
 
 
509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  55.24 
 
 
556 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  54.95 
 
 
506 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  52.43 
 
 
514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  56.2 
 
 
510 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  53.74 
 
 
517 aa  572  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  52.23 
 
 
509 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  52.04 
 
 
509 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  53.77 
 
 
517 aa  570  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.1 
 
 
511 aa  569  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  54.17 
 
 
513 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  55.3 
 
 
533 aa  568  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  54.56 
 
 
510 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  53.51 
 
 
522 aa  566  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  51.55 
 
 
512 aa  565  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  53.77 
 
 
523 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  53.59 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  51.84 
 
 
511 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  55 
 
 
525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  53 
 
 
517 aa  564  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  53.59 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  52.42 
 
 
520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2949  GMP synthase  51.69 
 
 
526 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  52.41 
 
 
523 aa  559  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  52.42 
 
 
520 aa  560  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  52 
 
 
528 aa  561  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  53.67 
 
 
514 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  53.77 
 
 
513 aa  558  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  53.58 
 
 
533 aa  558  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  52.01 
 
 
517 aa  558  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  53.67 
 
 
514 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  52.21 
 
 
525 aa  557  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.58 
 
 
526 aa  557  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  53.68 
 
 
512 aa  555  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  54.25 
 
 
535 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  53.49 
 
 
512 aa  558  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  51.06 
 
 
508 aa  556  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  51.43 
 
 
525 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  51.24 
 
 
525 aa  552  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  53.63 
 
 
515 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  52.58 
 
 
520 aa  554  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  52.88 
 
 
516 aa  552  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  53.24 
 
 
524 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  52.22 
 
 
515 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  51.05 
 
 
525 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  51.8 
 
 
531 aa  551  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>