More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0355 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  69.87 
 
 		 520 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  70.25 
 
 		 520 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  74.76 
 
 		 541 aa  787    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  72.2 
 
 		 521 aa  769    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  62.21 
 
 		 516 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  68.91 
 
 		 520 aa  743    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  72.43 
 
 		 518 aa  768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  61.38 
 
 		 517 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  62.33 
 
 		 514 aa  651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  68.33 
 
 		 518 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  75.1 
 
 		 524 aa  786    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  68.33 
 
 		 518 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  69.1 
 
 		 520 aa  754    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  72.2 
 
 		 535 aa  767    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  74.56 
 
 		 518 aa  771    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  74.37 
 
 		 518 aa  776    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  72.67 
 
 		 530 aa  769    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  73.7 
 
 		 520 aa  792    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  68.33 
 
 		 518 aa  717    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  72.2 
 
 		 521 aa  768    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  71.81 
 
 		 521 aa  765    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  71.65 
 
 		 565 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  75.48 
 
 		 526 aa  816    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  62.79 
 
 		 516 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1587  GMP synthase  66.47 
 
 		 520 aa  702    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0923509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  100 
 
 		 525 aa  1065    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  68.73 
 
 		 518 aa  745    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  71.84 
 
 		 540 aa  747    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  73.27 
 
 		 540 aa  783    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  64.08 
 
 		 535 aa  687    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  71.04 
 
 		 535 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  72.04 
 
 		 556 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  70.86 
 
 		 540 aa  761    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  67.32 
 
 		 528 aa  697    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  66.09 
 
 		 520 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  71.89 
 
 		 537 aa  762    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  68.91 
 
 		 520 aa  744    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  66.22 
 
 		 533 aa  706    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  70.96 
 
 		 519 aa  770    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  67.62 
 
 		 519 aa  728    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  68.57 
 
 		 523 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  70.06 
 
 		 520 aa  758    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  69.32 
 
 		 534 aa  723    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  72.57 
 
 		 519 aa  779    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  62.21 
 
 		 516 aa  661    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  62.33 
 
 		 514 aa  651    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  72.41 
 
 		 534 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  61.17 
 
 		 518 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  61.35 
 
 		 518 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  61.73 
 
 		 518 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  61.35 
 
 		 518 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  60 
 
 		 518 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  58.77 
 
 		 520 aa  616  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  59.01 
 
 		 527 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  59.89 
 
 		 522 aa  615  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  58.82 
 
 		 527 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  57.89 
 
 		 509 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  58 
 
 		 522 aa  611  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  57.78 
 
 		 517 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.6 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  57.06 
 
 		 510 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  58.06 
 
 		 527 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  59.58 
 
 		 523 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  57.31 
 
 		 513 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  59.26 
 
 		 516 aa  605  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  57.33 
 
 		 526 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  57.2 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  58.38 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  58.38 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  56.73 
 
 		 513 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  58.38 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  58 
 
 		 525 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  58.38 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  58.38 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  57.47 
 
 		 521 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  58.19 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  58.19 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  58.38 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  58.19 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  58.38 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.98 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  57.69 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  58.38 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  58.38 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  58.38 
 
 		 525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  56.92 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  57.61 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  57 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  56.35 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  57.5 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  57.8 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.92 
 
 		 511 aa  600  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  56.35 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  56.35 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  56.35 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  57.92 
 
 		 521 aa  595  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  57.42 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  58 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  58.77 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  56.92 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>