More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2123 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0836  GMP synthase  61.33 
 
 		 533 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  60.27 
 
 		 520 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  67.25 
 
 		 514 aa  703    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  63.44 
 
 		 518 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  59.53 
 
 		 511 aa  646    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  62.3 
 
 		 515 aa  669    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  59.45 
 
 		 511 aa  640    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  63.64 
 
 		 518 aa  675    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  61.72 
 
 		 560 aa  637    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  61.52 
 
 		 560 aa  637    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  61.67 
 
 		 515 aa  653    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  63.87 
 
 		 515 aa  677    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  60.08 
 
 		 521 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  60.47 
 
 		 520 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  64.02 
 
 		 525 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  59.5 
 
 		 511 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  60.62 
 
 		 516 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  62.38 
 
 		 510 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  66.6 
 
 		 516 aa  733    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  62.02 
 
 		 526 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  62.35 
 
 		 516 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  63.44 
 
 		 518 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  66.6 
 
 		 516 aa  734    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  60.46 
 
 		 521 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  61.52 
 
 		 513 aa  648    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  62.91 
 
 		 522 aa  664    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  60.27 
 
 		 521 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  59.84 
 
 		 511 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  58.56 
 
 		 511 aa  636    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  66.99 
 
 		 517 aa  741    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  66.02 
 
 		 516 aa  728    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  63.83 
 
 		 518 aa  682    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  59.45 
 
 		 511 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  64.57 
 
 		 511 aa  691    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  60.27 
 
 		 519 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  61.96 
 
 		 514 aa  672    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  100 
 
 		 518 aa  1059    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  59.92 
 
 		 511 aa  635    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  61.1 
 
 		 511 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  59.84 
 
 		 511 aa  641    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  67.25 
 
 		 514 aa  703    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  61.58 
 
 		 524 aa  641    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  63.37 
 
 		 541 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  61.52 
 
 		 515 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  60.08 
 
 		 512 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  59.69 
 
 		 520 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  57.88 
 
 		 575 aa  632  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  61.17 
 
 		 525 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  59.65 
 
 		 510 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  60.19 
 
 		 523 aa  634  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  59.45 
 
 		 518 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  58.45 
 
 		 537 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  59.22 
 
 		 520 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  59.42 
 
 		 520 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  61.58 
 
 		 520 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  59.61 
 
 		 520 aa  628  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  59.06 
 
 		 510 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  56.54 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  57.56 
 
 		 509 aa  631  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  58.43 
 
 		 512 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  56.35 
 
 		 575 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  60.46 
 
 		 518 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  59.42 
 
 		 520 aa  625  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  57.84 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  57.84 
 
 		 515 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  57.84 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  57.31 
 
 		 542 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  57.34 
 
 		 513 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  57.84 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  57.84 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  57.31 
 
 		 542 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  58.83 
 
 		 520 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  60.23 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  58.61 
 
 		 518 aa  626  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  57.84 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  60.39 
 
 		 519 aa  626  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  57.84 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  59.45 
 
 		 512 aa  625  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  57.45 
 
 		 512 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  58.54 
 
 		 523 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  60.31 
 
 		 530 aa  624  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  59.45 
 
 		 535 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  57.41 
 
 		 526 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  59.45 
 
 		 540 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  58.3 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  60.04 
 
 		 518 aa  623  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  59.11 
 
 		 520 aa  621  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  57.45 
 
 		 515 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  60.67 
 
 		 512 aa  618  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  59.1 
 
 		 512 aa  620  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  57.92 
 
 		 520 aa  619  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  55.83 
 
 		 540 aa  618  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4587  GMP synthase  57.58 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  57.58 
 
 		 527 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  58.53 
 
 		 534 aa  618  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  57.01 
 
 		 542 aa  619  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  57.84 
 
 		 512 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.2 
 
 		 517 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  59.45 
 
 		 565 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  59.25 
 
 		 510 aa  620  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>