More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0836 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0836  GMP synthase  100 
 
 		 533 aa  1102    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  56.95 
 
 		 513 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  59.49 
 
 		 510 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  95.87 
 
 		 560 aa  1039    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  94.37 
 
 		 560 aa  1031    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  56.84 
 
 		 513 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  62.43 
 
 		 516 aa  667    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  58.98 
 
 		 510 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  59.65 
 
 		 516 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  63.41 
 
 		 517 aa  674    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  63.8 
 
 		 516 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  59.77 
 
 		 511 aa  635    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  62.43 
 
 		 516 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  61.72 
 
 		 518 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  58.75 
 
 		 512 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  59.34 
 
 		 531 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  59.22 
 
 		 512 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  57.89 
 
 		 512 aa  628  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  58.98 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  58.98 
 
 		 515 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  58.98 
 
 		 515 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  59.38 
 
 		 512 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  58.98 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  59.18 
 
 		 512 aa  625  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  58.98 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  58.79 
 
 		 512 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  59.65 
 
 		 510 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  58.79 
 
 		 512 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  59.65 
 
 		 511 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  59.18 
 
 		 512 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  58.79 
 
 		 515 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  56.18 
 
 		 542 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  56.95 
 
 		 542 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  56.18 
 
 		 575 aa  618  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  56.95 
 
 		 542 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  58.12 
 
 		 513 aa  621  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  57.93 
 
 		 514 aa  618  1e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  56.37 
 
 		 575 aa  611  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  58.51 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  57.03 
 
 		 511 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  54.82 
 
 		 540 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  56.56 
 
 		 517 aa  610  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.81 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  58.17 
 
 		 515 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  57.17 
 
 		 506 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  54.63 
 
 		 540 aa  605  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  55.02 
 
 		 537 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.36 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  57.76 
 
 		 509 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  55.27 
 
 		 511 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  56.2 
 
 		 522 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  58.2 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  56.36 
 
 		 517 aa  600  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  55.51 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  57.67 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  56.29 
 
 		 528 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  56.29 
 
 		 528 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  54.48 
 
 		 528 aa  596  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  56.09 
 
 		 528 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  56.48 
 
 		 528 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  57.67 
 
 		 514 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  55.95 
 
 		 520 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  56.43 
 
 		 524 aa  594  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  53.93 
 
 		 520 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  54.29 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  55.25 
 
 		 533 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  55.03 
 
 		 526 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  56.24 
 
 		 524 aa  591  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  56.87 
 
 		 534 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  56.31 
 
 		 518 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  55.53 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  55.92 
 
 		 523 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  55.36 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  56.42 
 
 		 520 aa  588  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  55.53 
 
 		 520 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  54.79 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.95 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  55.51 
 
 		 525 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  55.32 
 
 		 548 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  55.62 
 
 		 556 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  54.08 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  56.61 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  55.53 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  53.37 
 
 		 525 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  56.5 
 
 		 518 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1032  GMP synthase  55.13 
 
 		 525 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1030  GMP synthase  55.13 
 
 		 525 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  54.6 
 
 		 517 aa  588  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  54.88 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  54.41 
 
 		 528 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  55.17 
 
 		 520 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  54.88 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  55.28 
 
 		 556 aa  585  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  54.76 
 
 		 513 aa  585  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  55.45 
 
 		 512 aa  588  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.17 
 
 		 509 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  54.53 
 
 		 525 aa  587  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  54.74 
 
 		 525 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  54.88 
 
 		 513 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  55.95 
 
 		 520 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>