More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0718 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  100 
 
 		 513 aa  1038    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  70.76 
 
 		 522 aa  748    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  58.19 
 
 		 522 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  59.73 
 
 		 511 aa  619  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.84 
 
 		 517 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  55.77 
 
 		 525 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  55.45 
 
 		 517 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  56.03 
 
 		 517 aa  594  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  55.45 
 
 		 517 aa  593  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  54.72 
 
 		 523 aa  591  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  57.53 
 
 		 501 aa  586  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  57.73 
 
 		 501 aa  588  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  55.36 
 
 		 525 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  57.48 
 
 		 531 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  56.64 
 
 		 514 aa  585  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  58.24 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54.67 
 
 		 515 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  54.6 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  55.94 
 
 		 513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  54.88 
 
 		 520 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  53.6 
 
 		 526 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  54.13 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  55.36 
 
 		 518 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  55.27 
 
 		 516 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  53.93 
 
 		 525 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  54.7 
 
 		 523 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  54.51 
 
 		 525 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  56.03 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  53.89 
 
 		 517 aa  579  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  56.34 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  53.85 
 
 		 525 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  53.85 
 
 		 525 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  56.12 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  52.93 
 
 		 518 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  53.27 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  55.36 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  55.36 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  55.08 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  53.74 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  52.88 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  54.21 
 
 		 521 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  55.66 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.92 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  53.65 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  54.67 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  53.65 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  55.32 
 
 		 524 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  54.47 
 
 		 512 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  54.89 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  54.98 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  53.85 
 
 		 525 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  55.27 
 
 		 510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  55.56 
 
 		 513 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  53.36 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.81 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  54.76 
 
 		 533 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  53.55 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  53.74 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  53.55 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  54.88 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  54.28 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  53.55 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  53.55 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  55.32 
 
 		 516 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  53.65 
 
 		 525 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  54.02 
 
 		 525 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  54.23 
 
 		 525 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  53.46 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  54.67 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  53.36 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  53.55 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  54.3 
 
 		 511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  54.79 
 
 		 511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  54.93 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  55.26 
 
 		 518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  55.25 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  54.37 
 
 		 560 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  53.36 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  54.17 
 
 		 560 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  52.93 
 
 		 518 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  54.79 
 
 		 513 aa  568  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  55.53 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  54.81 
 
 		 524 aa  571  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  54.37 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  53.68 
 
 		 519 aa  569  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  54.62 
 
 		 524 aa  569  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  53.64 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  54.65 
 
 		 512 aa  571  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1032  GMP synthase  53.65 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  53.91 
 
 		 511 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>