More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1423 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  68.59 
 
 		 512 aa  739    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  100 
 
 		 512 aa  1042    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  60.04 
 
 		 513 aa  634  1e-180  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  57.81 
 
 		 514 aa  601  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.4 
 
 		 511 aa  598  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  57.03 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.21 
 
 		 525 aa  588  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  53.96 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  53.96 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55 
 
 		 517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  53.96 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.96 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  55.13 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  53.96 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.96 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.96 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  53.82 
 
 		 522 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  53.89 
 
 		 525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  53.96 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.96 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  53.77 
 
 		 525 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  54.55 
 
 		 510 aa  578  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  53.77 
 
 		 525 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  54.42 
 
 		 517 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  53.95 
 
 		 516 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  53.22 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  53.77 
 
 		 525 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  53.92 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  54.42 
 
 		 517 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  54.34 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  53.58 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  55.43 
 
 		 516 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  55.34 
 
 		 512 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  52.85 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  55.53 
 
 		 517 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  52.83 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  52.92 
 
 		 525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  55.41 
 
 		 512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  53.58 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  54.83 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.95 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  54.83 
 
 		 515 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  54.83 
 
 		 515 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  54.83 
 
 		 515 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  52.73 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  53.57 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  54.83 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  54.35 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.83 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.95 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  55.41 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  54.83 
 
 		 501 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.83 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  55.02 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  53.5 
 
 		 509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  53.7 
 
 		 509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  53.95 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  52.73 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  52.5 
 
 		 518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  53.86 
 
 		 520 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  52.35 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  52.02 
 
 		 521 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  53.27 
 
 		 521 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  53.18 
 
 		 520 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  54.65 
 
 		 513 aa  571  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  53.36 
 
 		 526 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  53.08 
 
 		 520 aa  571  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  54.58 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  53.3 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  54.29 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  52.87 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  52.88 
 
 		 520 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  53.07 
 
 		 527 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  53.05 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  53.32 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  54.3 
 
 		 517 aa  565  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  52.35 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  52.15 
 
 		 526 aa  565  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  53.58 
 
 		 515 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  52.35 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  53.2 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  52.22 
 
 		 517 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  52.35 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  53.26 
 
 		 523 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  52.26 
 
 		 523 aa  565  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  52.63 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  52.1 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  53.22 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  55.08 
 
 		 517 aa  567  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  52.17 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  51.9 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  52.09 
 
 		 525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  52.44 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  52.44 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  51.71 
 
 		 532 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  52.31 
 
 		 515 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  52.28 
 
 		 542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  52.44 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  52.63 
 
 		 525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  52.63 
 
 		 525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>