More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1557 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  59.8 
 
 		 513 aa  636    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  100 
 
 		 512 aa  1043    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  68.59 
 
 		 512 aa  739    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  60.27 
 
 		 514 aa  624  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  56.62 
 
 		 525 aa  609  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  54.86 
 
 		 518 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  57.2 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  56.62 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  57.01 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  55.05 
 
 		 522 aa  600  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  57 
 
 		 508 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  56.05 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  54.26 
 
 		 515 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  56.42 
 
 		 517 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  55.17 
 
 		 517 aa  595  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  55.28 
 
 		 525 aa  598  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  56.62 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  56.62 
 
 		 525 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.36 
 
 		 517 aa  595  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  56.62 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  56.43 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  55.75 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  55.75 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  55.75 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  56.43 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  56.81 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  56.81 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.45 
 
 		 516 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  55.36 
 
 		 517 aa  591  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  56.43 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  54.95 
 
 		 515 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  56.75 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  55.95 
 
 		 526 aa  593  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  57.01 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.84 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  55.64 
 
 		 509 aa  592  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  56.43 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  56.14 
 
 		 517 aa  593  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  55.75 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  56.51 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.92 
 
 		 520 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  55.85 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  54.51 
 
 		 525 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  56.24 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  56.7 
 
 		 525 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  56.24 
 
 		 525 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  56.2 
 
 		 520 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.56 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  54.73 
 
 		 520 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  55.17 
 
 		 512 aa  586  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.56 
 
 		 516 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54.17 
 
 		 515 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.28 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.09 
 
 		 509 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  55.66 
 
 		 523 aa  586  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  55.09 
 
 		 525 aa  587  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  55.23 
 
 		 520 aa  585  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  53.49 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  54.41 
 
 		 525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  53.67 
 
 		 533 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  54.39 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  54.41 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  54.46 
 
 		 518 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  55.75 
 
 		 521 aa  579  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  54.79 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  54.79 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  51.92 
 
 		 575 aa  579  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  54.51 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  53.68 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  54.51 
 
 		 525 aa  578  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  54.79 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  53.68 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2949  GMP synthase  55.73 
 
 		 526 aa  581  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  56.36 
 
 		 511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  54.2 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  54.28 
 
 		 509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  55.13 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  54.25 
 
 		 528 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  54.76 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  54.01 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  53.27 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  53 
 
 		 521 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  54.65 
 
 		 516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  53.38 
 
 		 521 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  54.05 
 
 		 528 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  51.35 
 
 		 575 aa  575  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  53.85 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  52.94 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  54.55 
 
 		 512 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  54.42 
 
 		 523 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>