More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0595 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  69.14 
 
 
511 aa  750    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  60.55 
 
 
511 aa  650    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  71.2 
 
 
510 aa  741    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  70.74 
 
 
516 aa  769    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  68.75 
 
 
511 aa  746    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  100 
 
 
511 aa  1059    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  69.53 
 
 
511 aa  754    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  71.99 
 
 
510 aa  758    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  69.34 
 
 
511 aa  752    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  68.55 
 
 
511 aa  745    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  71.09 
 
 
510 aa  747    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  59.3 
 
 
518 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  57.59 
 
 
517 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  58.57 
 
 
526 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.79 
 
 
516 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  58.51 
 
 
518 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  58.51 
 
 
518 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  58.71 
 
 
518 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  57.4 
 
 
516 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  57.4 
 
 
516 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  57 
 
 
514 aa  608  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  56.92 
 
 
518 aa  611  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  57.68 
 
 
512 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  57.87 
 
 
512 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  57.25 
 
 
514 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  57.25 
 
 
514 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  57.79 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  57.87 
 
 
512 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  57.28 
 
 
515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  57.28 
 
 
515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  57.28 
 
 
515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  57.48 
 
 
512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  57.28 
 
 
512 aa  599  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  57.28 
 
 
515 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  57.28 
 
 
512 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  57.28 
 
 
512 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  56.8 
 
 
512 aa  598  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  56.89 
 
 
514 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  55.82 
 
 
513 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  57.7 
 
 
525 aa  596  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  56.42 
 
 
513 aa  594  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  56.5 
 
 
509 aa  592  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  56.47 
 
 
520 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  56.16 
 
 
524 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.75 
 
 
512 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.25 
 
 
510 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  55.03 
 
 
513 aa  591  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  56.29 
 
 
533 aa  588  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  57 
 
 
513 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  55.23 
 
 
510 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  56.36 
 
 
518 aa  587  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  56.53 
 
 
530 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  56.78 
 
 
515 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  55.45 
 
 
518 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  56.92 
 
 
507 aa  586  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  56.01 
 
 
537 aa  586  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  56.64 
 
 
519 aa  585  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  56.36 
 
 
528 aa  586  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  55.69 
 
 
520 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  55.97 
 
 
521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  55.97 
 
 
521 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  56.01 
 
 
520 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  56.67 
 
 
525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  55.64 
 
 
513 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  54.69 
 
 
511 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  55.77 
 
 
521 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  55.6 
 
 
522 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  56.36 
 
 
541 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  55.91 
 
 
517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  55.97 
 
 
520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  56.03 
 
 
513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  56.02 
 
 
513 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  56.75 
 
 
518 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.12 
 
 
517 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  55.31 
 
 
517 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  55.04 
 
 
526 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  56.01 
 
 
542 aa  581  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  55.97 
 
 
520 aa  581  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  56.56 
 
 
520 aa  579  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  55.82 
 
 
513 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  55.82 
 
 
513 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  53.85 
 
 
509 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  54.64 
 
 
513 aa  580  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  55.51 
 
 
517 aa  580  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  54.99 
 
 
534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  55.58 
 
 
520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  55.4 
 
 
515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  55.43 
 
 
525 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  55.77 
 
 
520 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  55.97 
 
 
520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.38 
 
 
520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  54.67 
 
 
516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  54.99 
 
 
520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  55.03 
 
 
516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  55.03 
 
 
511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  55.97 
 
 
523 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  53.65 
 
 
509 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  56.36 
 
 
518 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  54.92 
 
 
517 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  55.62 
 
 
525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>