More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3517 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  68.85 
 
 		 528 aa  736    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  61.01 
 
 		 514 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  74.27 
 
 		 565 aa  816    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  69.98 
 
 		 518 aa  744    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  75.82 
 
 		 521 aa  817    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  76.6 
 
 		 521 aa  822    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  76.4 
 
 		 521 aa  822    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  100 
 
 		 520 aa  1067    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  84.81 
 
 		 520 aa  927    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  69.62 
 
 		 520 aa  762    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  73.17 
 
 		 533 aa  783    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  72.18 
 
 		 530 aa  790    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  76.4 
 
 		 524 aa  829    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  68.77 
 
 		 518 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  76.41 
 
 		 518 aa  823    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  76.6 
 
 		 518 aa  840    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  74.85 
 
 		 535 aa  821    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  60.77 
 
 		 516 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  76.02 
 
 		 534 aa  826    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  68.77 
 
 		 518 aa  732    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  93.46 
 
 		 520 aa  1012    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  84.81 
 
 		 520 aa  928    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  74.66 
 
 		 518 aa  797    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  73.08 
 
 		 534 aa  790    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  60 
 
 		 517 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  61.01 
 
 		 514 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  70.06 
 
 		 525 aa  758    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  74.07 
 
 		 540 aa  802    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  72.71 
 
 		 540 aa  791    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  70.1 
 
 		 541 aa  761    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  67.88 
 
 		 535 aa  726    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  75.24 
 
 		 535 aa  820    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  60.38 
 
 		 516 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  74.66 
 
 		 556 aa  824    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  60.77 
 
 		 516 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  73.75 
 
 		 540 aa  814    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  69.13 
 
 		 519 aa  748    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  85.58 
 
 		 523 aa  937    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  70.17 
 
 		 520 aa  750    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  71.84 
 
 		 537 aa  785    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  85.38 
 
 		 519 aa  925    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  74.66 
 
 		 518 aa  799    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  91.15 
 
 		 520 aa  994    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1587  GMP synthase  69.92 
 
 		 520 aa  750    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0923509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  93.46 
 
 		 520 aa  1012    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  70.46 
 
 		 519 aa  766    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  72.9 
 
 		 526 aa  784    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  60.5 
 
 		 518 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  59.42 
 
 		 518 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  60.31 
 
 		 518 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  60.69 
 
 		 518 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  60.12 
 
 		 518 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  58.4 
 
 		 522 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  57.93 
 
 		 515 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  55.43 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  55.43 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  55.43 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  55.43 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  57.53 
 
 		 515 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  55.43 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  55.81 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.95 
 
 		 511 aa  598  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  55.81 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  55.81 
 
 		 525 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  55.43 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  55.43 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.58 
 
 		 509 aa  598  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.56 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  55.43 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  55.43 
 
 		 525 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  55.05 
 
 		 525 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  55.81 
 
 		 527 aa  598  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  56.98 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  54.86 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  55.62 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  55.84 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  56.92 
 
 		 515 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  55.62 
 
 		 525 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  56.42 
 
 		 511 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  56.6 
 
 		 532 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.14 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  53.65 
 
 		 517 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  56.59 
 
 		 522 aa  594  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  57.78 
 
 		 525 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  54.48 
 
 		 525 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  54.67 
 
 		 525 aa  591  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  55.38 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  56.34 
 
 		 512 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  56.92 
 
 		 515 aa  591  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2058  GMP synthase  56.61 
 
 		 599 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  56.59 
 
 		 521 aa  588  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  53.71 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2402  GMP synthase  56.61 
 
 		 539 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.630699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2454  GMP synthase  56.61 
 
 		 539 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  56.14 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3290  GMP synthase  56.61 
 
 		 539 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0624455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  53.71 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  55.24 
 
 		 527 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  53.71 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  55.87 
 
 		 539 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>