More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0241 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  100 
 
 		 513 aa  1049    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  88.69 
 
 		 513 aa  949    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  86.16 
 
 		 513 aa  914    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  82.65 
 
 		 511 aa  879    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  85.21 
 
 		 514 aa  900    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  84.44 
 
 		 518 aa  897    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  88.69 
 
 		 513 aa  934    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  59.77 
 
 		 511 aa  629  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  59.74 
 
 		 522 aa  622  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  58.49 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  57.77 
 
 		 518 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.26 
 
 		 516 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  57.09 
 
 		 511 aa  595  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  56.23 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.68 
 
 		 516 aa  594  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  56.89 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  57.56 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.68 
 
 		 516 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  56.01 
 
 		 509 aa  592  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  56.5 
 
 		 511 aa  591  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  56.87 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  55.13 
 
 		 520 aa  588  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.02 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  56.7 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  57 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  57.09 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  54.35 
 
 		 517 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  55.49 
 
 		 515 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  58.09 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  56.41 
 
 		 515 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  57.5 
 
 		 519 aa  586  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  55.62 
 
 		 514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.9 
 
 		 520 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  55.71 
 
 		 516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  57.01 
 
 		 518 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  58.08 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  55.84 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  55.62 
 
 		 514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  56.98 
 
 		 510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  57.2 
 
 		 518 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  55.13 
 
 		 508 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  56.59 
 
 		 509 aa  581  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  55.92 
 
 		 526 aa  579  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  56.4 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  56.81 
 
 		 518 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  56.31 
 
 		 512 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  55.06 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  56.07 
 
 		 520 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  54.84 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  55.43 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  55.04 
 
 		 509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  54.98 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54.74 
 
 		 515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  54.93 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  56.08 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  56.11 
 
 		 524 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  54.91 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  55.98 
 
 		 524 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  55.23 
 
 		 520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.77 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  55.22 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  54.67 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  54.67 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  56.09 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  55.79 
 
 		 512 aa  571  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  55.06 
 
 		 515 aa  571  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  55.62 
 
 		 520 aa  571  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  55.92 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  54.13 
 
 		 528 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  55.41 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  56.26 
 
 		 518 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  53.99 
 
 		 542 aa  568  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  53.49 
 
 		 509 aa  567  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  55.15 
 
 		 513 aa  565  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  55.03 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  55.03 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  54.65 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  53.56 
 
 		 533 aa  567  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  55.03 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  55.22 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  55.88 
 
 		 518 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  53.97 
 
 		 512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.1 
 
 		 512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  55.34 
 
 		 525 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  53.77 
 
 		 565 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  55.73 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  55.03 
 
 		 525 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.76 
 
 		 516 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  54.51 
 
 		 522 aa  562  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  54.14 
 
 		 526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.65 
 
 		 511 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  54.76 
 
 		 506 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  54.94 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  54.58 
 
 		 525 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  55.15 
 
 		 525 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  54.23 
 
 		 523 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>