More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0645 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  62.62 
 
 
511 aa  637    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  100 
 
 
507 aa  1036    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  59.88 
 
 
511 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  58.95 
 
 
518 aa  601  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  57.73 
 
 
518 aa  591  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  58.28 
 
 
513 aa  590  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  58.24 
 
 
513 aa  587  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  57 
 
 
511 aa  585  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  56.92 
 
 
511 aa  586  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  58.09 
 
 
513 aa  587  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  57.98 
 
 
514 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  56.72 
 
 
511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  57.7 
 
 
513 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  57.59 
 
 
511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  54.79 
 
 
522 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  56.72 
 
 
511 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  57.71 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  56.72 
 
 
511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  57.4 
 
 
514 aa  580  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.02 
 
 
517 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57 
 
 
516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.74 
 
 
516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  57.31 
 
 
513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  57.68 
 
 
516 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  57.28 
 
 
516 aa  571  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  56.08 
 
 
510 aa  565  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  56.16 
 
 
522 aa  567  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  55.88 
 
 
510 aa  568  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  55.14 
 
 
510 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  54.4 
 
 
513 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  55.93 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  54.21 
 
 
518 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  56.41 
 
 
501 aa  559  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  55.86 
 
 
524 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  55.12 
 
 
509 aa  559  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  54.21 
 
 
518 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  54.4 
 
 
518 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  54.94 
 
 
511 aa  560  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  54.01 
 
 
518 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  56.63 
 
 
501 aa  561  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  55.97 
 
 
511 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  51.65 
 
 
528 aa  557  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  56.39 
 
 
515 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  54.67 
 
 
526 aa  558  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.95 
 
 
512 aa  555  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  53.85 
 
 
517 aa  556  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  55.99 
 
 
515 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  53.56 
 
 
512 aa  551  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  53.36 
 
 
515 aa  552  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  53.36 
 
 
512 aa  551  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  54.88 
 
 
516 aa  554  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  51.38 
 
 
513 aa  551  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  54.15 
 
 
512 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.79 
 
 
509 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  53.36 
 
 
512 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  53.75 
 
 
512 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  53.36 
 
 
515 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  53.36 
 
 
515 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  53.01 
 
 
527 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  54.26 
 
 
514 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  55.64 
 
 
512 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  53.56 
 
 
512 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  55.47 
 
 
565 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  55.66 
 
 
556 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  54.26 
 
 
514 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  54.49 
 
 
519 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.6 
 
 
509 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  54.1 
 
 
530 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  53.65 
 
 
517 aa  550  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  53.95 
 
 
510 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  51.76 
 
 
512 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  53.36 
 
 
512 aa  547  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  54.99 
 
 
518 aa  548  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  54.3 
 
 
540 aa  545  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  53.36 
 
 
515 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  54.39 
 
 
512 aa  545  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  52.48 
 
 
513 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  53.36 
 
 
510 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  53.07 
 
 
513 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  51.75 
 
 
516 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  52.48 
 
 
513 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  53.65 
 
 
513 aa  542  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  53.91 
 
 
535 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  53.65 
 
 
511 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  54.97 
 
 
516 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  53.97 
 
 
540 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  53.49 
 
 
525 aa  541  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  53.61 
 
 
520 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  53.32 
 
 
520 aa  542  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  53.52 
 
 
518 aa  542  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  53.83 
 
 
560 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  54.49 
 
 
525 aa  540  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  55.08 
 
 
540 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  54.49 
 
 
535 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  53.03 
 
 
520 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  52.27 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  53.61 
 
 
520 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  53.35 
 
 
517 aa  540  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  51.56 
 
 
512 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  51.74 
 
 
529 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>