More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0501 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  91.98 
 
 		 511 aa  986    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  80.24 
 
 		 510 aa  837    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  91.98 
 
 		 511 aa  985    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  60.55 
 
 		 511 aa  652    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  92.37 
 
 		 511 aa  988    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  69.53 
 
 		 511 aa  754    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  66.09 
 
 		 516 aa  703    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  77.27 
 
 		 510 aa  827    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  75.15 
 
 		 511 aa  813    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  59.84 
 
 		 518 aa  641    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  100 
 
 		 511 aa  1055    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  80.04 
 
 		 510 aa  853    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  57.53 
 
 		 518 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  57.31 
 
 		 512 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  57.59 
 
 		 517 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  57.45 
 
 		 512 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  58.19 
 
 		 516 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  56.52 
 
 		 515 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  56.34 
 
 		 512 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  56.34 
 
 		 512 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  56.34 
 
 		 512 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  58.19 
 
 		 516 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  56.95 
 
 		 512 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.75 
 
 		 510 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  56.14 
 
 		 512 aa  608  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  56.52 
 
 		 515 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  56.52 
 
 		 515 aa  610  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  56.14 
 
 		 512 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  56.34 
 
 		 512 aa  608  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  58.38 
 
 		 516 aa  611  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  56.32 
 
 		 515 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  58.46 
 
 		 510 aa  608  9.999999999999999e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  56.13 
 
 		 513 aa  601  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  56.56 
 
 		 518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  56.36 
 
 		 518 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.56 
 
 		 510 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  56.56 
 
 		 518 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  56.84 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  56.84 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  56.89 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  55.8 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  54.94 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  56.2 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.94 
 
 		 516 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  54.94 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  55.43 
 
 		 526 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  56.19 
 
 		 515 aa  592  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  53.75 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  56.34 
 
 		 511 aa  589  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  56.5 
 
 		 513 aa  591  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  53.36 
 
 		 509 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  54.94 
 
 		 513 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  56.7 
 
 		 513 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.23 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  56.01 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  56.16 
 
 		 520 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  57 
 
 		 507 aa  585  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  55.94 
 
 		 526 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  53.36 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  55.81 
 
 		 514 aa  585  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  54.83 
 
 		 517 aa  586  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  56.23 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.49 
 
 		 511 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  53.75 
 
 		 506 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  54.83 
 
 		 517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.47 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  54.79 
 
 		 520 aa  578  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  54.03 
 
 		 520 aa  578  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  55.04 
 
 		 524 aa  578  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  53.86 
 
 		 522 aa  578  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  54.07 
 
 		 526 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  54.65 
 
 		 525 aa  579  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  54.07 
 
 		 523 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  54.76 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  54.65 
 
 		 542 aa  578  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  53.7 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  55.08 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  54.3 
 
 		 527 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1262  GMP synthase  54.26 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  54.53 
 
 		 514 aa  573  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  53.95 
 
 		 509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  54.26 
 
 		 527 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  54.6 
 
 		 520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.02 
 
 		 575 aa  571  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  54.1 
 
 		 530 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  53.29 
 
 		 529 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  54.99 
 
 		 515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  53.29 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  53.29 
 
 		 524 aa  568  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  52.25 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  53.89 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  54.07 
 
 		 522 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  53.41 
 
 		 525 aa  569  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  54.3 
 
 		 527 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  54.26 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  52.57 
 
 		 513 aa  570  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  53.88 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  54.6 
 
 		 520 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  54.58 
 
 		 515 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  54 
 
 		 515 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>