More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2377 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  100 
 
 		 509 aa  1048    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  61.89 
 
 		 506 aa  671    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  68.57 
 
 		 509 aa  729    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  80.75 
 
 		 509 aa  853    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  69.17 
 
 		 510 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  69.35 
 
 		 509 aa  724    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  69.94 
 
 		 508 aa  760    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  64.45 
 
 		 512 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  78.02 
 
 		 515 aa  819    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  55.25 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  55.81 
 
 		 513 aa  580  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  55.04 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  55.13 
 
 		 518 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  56.01 
 
 		 513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  55.13 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  53.77 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  53.88 
 
 		 514 aa  559  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  52.72 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  52.73 
 
 		 511 aa  553  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  54.22 
 
 		 516 aa  551  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  52.33 
 
 		 515 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  53.42 
 
 		 518 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  53.31 
 
 		 516 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  54.03 
 
 		 516 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  52.75 
 
 		 517 aa  551  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  52.31 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  52.31 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  52.31 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  52.5 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  52.12 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  52.5 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  52.5 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  52.5 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  52.12 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  52.12 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  53.2 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  54.56 
 
 		 515 aa  548  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.42 
 
 		 517 aa  544  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  52.31 
 
 		 525 aa  545  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  53.59 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  52.93 
 
 		 511 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  51.92 
 
 		 525 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  52.12 
 
 		 525 aa  543  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  51.92 
 
 		 525 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.31 
 
 		 511 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  50.86 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  51.73 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  52.05 
 
 		 517 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  51.95 
 
 		 518 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  50.96 
 
 		 525 aa  537  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  52.64 
 
 		 517 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  51.27 
 
 		 517 aa  531  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  51.27 
 
 		 518 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  52.63 
 
 		 515 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  52.26 
 
 		 516 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  53.61 
 
 		 515 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  50.89 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  51.17 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  51.16 
 
 		 525 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  50.96 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  52.63 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  51.35 
 
 		 525 aa  531  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  51.65 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  50.58 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  51.17 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  51.54 
 
 		 525 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  51.18 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  51.26 
 
 		 522 aa  525  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  50.87 
 
 		 523 aa  526  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  51.74 
 
 		 519 aa  528  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  51.54 
 
 		 525 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  50.29 
 
 		 521 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  50.78 
 
 		 520 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  50.29 
 
 		 525 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  52.44 
 
 		 535 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  50.98 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  51.36 
 
 		 526 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  49.52 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  48.04 
 
 		 513 aa  519  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  49.62 
 
 		 525 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  50.69 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  50.68 
 
 		 523 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  50 
 
 		 521 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  49.9 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70121  GMP synthase  50.58 
 
 		 528 aa  520  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.0696406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  50.88 
 
 		 520 aa  521  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  50.29 
 
 		 525 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  49.71 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  51.36 
 
 		 556 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  51.16 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  50.29 
 
 		 520 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  51.16 
 
 		 525 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  50.77 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  51.47 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  50.67 
 
 		 525 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  50.1 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  49.52 
 
 		 525 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  50.67 
 
 		 525 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  49.42 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  49.23 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>