More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0589 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0589  GMP synthase  100 
 
 		 506 aa  1037    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  63.46 
 
 		 509 aa  688    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  65.22 
 
 		 515 aa  690    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  63.46 
 
 		 509 aa  676    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  62.92 
 
 		 510 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  61.89 
 
 		 509 aa  671    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  63.26 
 
 		 508 aa  690    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  62.5 
 
 		 512 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  64.24 
 
 		 509 aa  696    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.79 
 
 		 522 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  56.08 
 
 		 517 aa  585  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  55.88 
 
 		 516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  55.69 
 
 		 516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  56.27 
 
 		 516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.8 
 
 		 511 aa  568  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  56.05 
 
 		 511 aa  568  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  55.43 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  52.84 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.47 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  55.04 
 
 		 522 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.47 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  53.47 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.47 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.47 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  55.29 
 
 		 518 aa  559  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  53.47 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  53.47 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  54.65 
 
 		 522 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  53.47 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  53.47 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  54.53 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  55.12 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  54.28 
 
 		 520 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  54.25 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  54.25 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  53.28 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  53.28 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  53.47 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  53.28 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.31 
 
 		 516 aa  555  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  54.09 
 
 		 520 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  53.5 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  54.84 
 
 		 521 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  53.37 
 
 		 521 aa  551  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  53.09 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  55.06 
 
 		 523 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  55.58 
 
 		 515 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  52.9 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  53.75 
 
 		 505 aa  549  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  52.32 
 
 		 525 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  53.24 
 
 		 517 aa  551  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  54.13 
 
 		 510 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  54.09 
 
 		 520 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  54.25 
 
 		 523 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  54.09 
 
 		 520 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  52.41 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  54 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  52.51 
 
 		 525 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  52.6 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  53.11 
 
 		 520 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  53.8 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  53.35 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  52.61 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  53.09 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  54.33 
 
 		 512 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  52.93 
 
 		 526 aa  545  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  52.7 
 
 		 525 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  52.72 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  53.09 
 
 		 527 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  52.51 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  52.6 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  52.22 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  54.09 
 
 		 519 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  52.51 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  52.32 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  53.95 
 
 		 525 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  53.62 
 
 		 517 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  52.6 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  52.9 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  52.51 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  52.6 
 
 		 525 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  53.37 
 
 		 524 aa  541  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  52.95 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  53.15 
 
 		 513 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  52.22 
 
 		 525 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  53.17 
 
 		 520 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  53.01 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  54.4 
 
 		 515 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  52.95 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.42 
 
 		 575 aa  541  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  53.91 
 
 		 511 aa  542  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  54.09 
 
 		 526 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  53.18 
 
 		 525 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  52.75 
 
 		 509 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  52.75 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  51.93 
 
 		 525 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  52.84 
 
 		 527 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  52.62 
 
 		 519 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  52.64 
 
 		 517 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  52.06 
 
 		 517 aa  541  1e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>