More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0598 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  70.41 
 
 
507 aa  733    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  100 
 
 
505 aa  1022    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  70.67 
 
 
508 aa  734    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  57.71 
 
 
516 aa  579  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  55.91 
 
 
516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  55.23 
 
 
511 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.32 
 
 
510 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  54.72 
 
 
517 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  57.96 
 
 
513 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  54.13 
 
 
523 aa  566  1e-160  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  55.9 
 
 
520 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  57.31 
 
 
513 aa  567  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  54.13 
 
 
516 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  54.33 
 
 
516 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  54.28 
 
 
542 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.65 
 
 
522 aa  558  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  55.62 
 
 
528 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  54.44 
 
 
511 aa  559  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  54.67 
 
 
575 aa  559  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  55.06 
 
 
542 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.44 
 
 
511 aa  557  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.85 
 
 
511 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  55.06 
 
 
542 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  55.04 
 
 
528 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  55.06 
 
 
575 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  53.49 
 
 
528 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  55.23 
 
 
548 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  55.32 
 
 
522 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  54.49 
 
 
526 aa  555  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  53.52 
 
 
515 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  52.71 
 
 
528 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  52.77 
 
 
509 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  52.96 
 
 
509 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  55.06 
 
 
537 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  53.1 
 
 
528 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  55.27 
 
 
520 aa  548  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  53.75 
 
 
506 aa  549  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  52.71 
 
 
528 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  55.23 
 
 
528 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  53.36 
 
 
513 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  54.71 
 
 
533 aa  548  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1072  GMP synthase  54.07 
 
 
525 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  55.04 
 
 
523 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1032  GMP synthase  53.88 
 
 
525 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  53.88 
 
 
527 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  53.01 
 
 
513 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  54.88 
 
 
520 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  54.26 
 
 
528 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  54.58 
 
 
527 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  51.97 
 
 
514 aa  547  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  52.64 
 
 
513 aa  547  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  54.16 
 
 
521 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  54.07 
 
 
525 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  52.47 
 
 
507 aa  542  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  52.86 
 
 
515 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  52.86 
 
 
512 aa  541  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  52.86 
 
 
515 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  52.86 
 
 
515 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  52.86 
 
 
515 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  53.7 
 
 
522 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  53.68 
 
 
525 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  54.12 
 
 
531 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  54.07 
 
 
528 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  54.28 
 
 
540 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  52.86 
 
 
512 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  54.07 
 
 
525 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  53.36 
 
 
510 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  52.86 
 
 
512 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  53.75 
 
 
512 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  54.39 
 
 
527 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.72 
 
 
510 aa  544  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  55.66 
 
 
518 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  54.15 
 
 
510 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  54.12 
 
 
516 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  56.39 
 
 
512 aa  544  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  54.65 
 
 
526 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1030  GMP synthase  53.68 
 
 
525 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  53.5 
 
 
522 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  56.45 
 
 
518 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  53.63 
 
 
514 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  52.51 
 
 
525 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  52.51 
 
 
525 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  52.66 
 
 
512 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.06 
 
 
512 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.37 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  56.19 
 
 
512 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  53.61 
 
 
516 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  53.23 
 
 
519 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  53.23 
 
 
519 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  55.73 
 
 
506 aa  538  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  52.05 
 
 
522 aa  539  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  54.49 
 
 
520 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  54.39 
 
 
527 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  53.23 
 
 
519 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  53.89 
 
 
540 aa  536  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  53.07 
 
 
513 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  55.86 
 
 
518 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  51.18 
 
 
517 aa  537  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  53.74 
 
 
518 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  52.66 
 
 
512 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>