More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1190 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  73.49 
 
 
523 aa  717    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  73.63 
 
 
517 aa  739    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  72.23 
 
 
516 aa  751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  72.15 
 
 
517 aa  740    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  73.2 
 
 
520 aa  754    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  72.67 
 
 
528 aa  738    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  74.85 
 
 
533 aa  768    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  70.77 
 
 
529 aa  730    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0910  GMP synthase, large subunit  79.07 
 
 
519 aa  821    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  71.9 
 
 
523 aa  744    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  70.87 
 
 
527 aa  717    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  73.01 
 
 
526 aa  752    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  68.41 
 
 
520 aa  715    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  74.57 
 
 
526 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  66.99 
 
 
556 aa  673    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  90.8 
 
 
522 aa  954    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  72.25 
 
 
547 aa  739    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  70.71 
 
 
539 aa  719    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  72.14 
 
 
524 aa  755    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  71.1 
 
 
534 aa  729    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  87.33 
 
 
525 aa  905    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  66.15 
 
 
534 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  78.91 
 
 
514 aa  815    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  100 
 
 
519 aa  1040    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  68.09 
 
 
520 aa  702    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  100 
 
 
519 aa  1040    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  71.95 
 
 
517 aa  736    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  79.54 
 
 
519 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  79.34 
 
 
535 aa  821    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  71.15 
 
 
529 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  70.19 
 
 
522 aa  727    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  69.96 
 
 
533 aa  734    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  72.71 
 
 
523 aa  757    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  71.81 
 
 
527 aa  739    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  73.06 
 
 
527 aa  770    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  100 
 
 
519 aa  1040    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  90.8 
 
 
522 aa  949    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  74.37 
 
 
515 aa  756    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  59.38 
 
 
516 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  61.13 
 
 
506 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  57.88 
 
 
513 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  58.89 
 
 
517 aa  593  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.25 
 
 
512 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  55.47 
 
 
515 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  58.48 
 
 
533 aa  594  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.84 
 
 
510 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.45 
 
 
510 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  55.27 
 
 
515 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  55.27 
 
 
515 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  55.27 
 
 
512 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  55.27 
 
 
512 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  55.47 
 
 
513 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  55.08 
 
 
512 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.88 
 
 
512 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.88 
 
 
515 aa  586  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  55.66 
 
 
510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.69 
 
 
512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.91 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.49 
 
 
509 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.3 
 
 
509 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  54.1 
 
 
512 aa  579  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.22 
 
 
511 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  51.66 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  51.66 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  56.92 
 
 
518 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  51.63 
 
 
517 aa  560  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  53.97 
 
 
512 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  52.61 
 
 
520 aa  559  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  52.43 
 
 
533 aa  555  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  51.27 
 
 
513 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  52.24 
 
 
511 aa  555  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  57.89 
 
 
518 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  51.84 
 
 
560 aa  555  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.93 
 
 
510 aa  556  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  57.7 
 
 
518 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  57.7 
 
 
518 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  52.05 
 
 
511 aa  552  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  51.35 
 
 
513 aa  551  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  51.65 
 
 
560 aa  551  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  54.1 
 
 
510 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  51.84 
 
 
511 aa  545  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  52.42 
 
 
520 aa  547  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  53.08 
 
 
535 aa  545  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  53.17 
 
 
528 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.73 
 
 
510 aa  546  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  51.44 
 
 
528 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  51.95 
 
 
508 aa  547  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  51.84 
 
 
517 aa  544  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54 
 
 
515 aa  542  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  51.46 
 
 
516 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  50.49 
 
 
517 aa  543  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  52.05 
 
 
516 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  52.98 
 
 
528 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  53.23 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  54.17 
 
 
518 aa  541  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  52.05 
 
 
516 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  56.25 
 
 
512 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  51.59 
 
 
529 aa  538  1e-151  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  53.97 
 
 
520 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  54.16 
 
 
510 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>