More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2184 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  84.45 
 
 
508 aa  875    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  100 
 
 
507 aa  1014    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  70.41 
 
 
505 aa  733    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  57.09 
 
 
516 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.51 
 
 
522 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  55.56 
 
 
510 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  54.01 
 
 
513 aa  547  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  55.91 
 
 
513 aa  546  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  53.88 
 
 
528 aa  542  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.91 
 
 
527 aa  542  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  52.85 
 
 
511 aa  541  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  54.49 
 
 
517 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  54 
 
 
522 aa  535  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  52.41 
 
 
525 aa  535  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  52.41 
 
 
525 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  54.99 
 
 
517 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  53.05 
 
 
511 aa  538  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  53.89 
 
 
520 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  52.17 
 
 
523 aa  532  1e-150  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  53.89 
 
 
520 aa  531  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  54.84 
 
 
527 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  53.91 
 
 
531 aa  535  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  52.76 
 
 
506 aa  528  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  54.28 
 
 
513 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  54.6 
 
 
519 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  53.2 
 
 
534 aa  528  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  51.37 
 
 
512 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  53.58 
 
 
523 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  51.87 
 
 
517 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  53.92 
 
 
516 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  52.73 
 
 
516 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  51.56 
 
 
512 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  51.17 
 
 
515 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  51.63 
 
 
528 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  53.71 
 
 
533 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  54.76 
 
 
533 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  52.44 
 
 
516 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  50.29 
 
 
507 aa  528  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  51.17 
 
 
512 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  51.06 
 
 
528 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  53.68 
 
 
520 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  52.44 
 
 
516 aa  528  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  53.41 
 
 
511 aa  528  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  52.22 
 
 
542 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  51.64 
 
 
575 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  53.67 
 
 
525 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  52.64 
 
 
512 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  51.17 
 
 
512 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  51.56 
 
 
512 aa  528  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  51.17 
 
 
512 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  53.89 
 
 
512 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  50.98 
 
 
512 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  54.79 
 
 
517 aa  525  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  50.68 
 
 
513 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  51.17 
 
 
515 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  51.17 
 
 
515 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  51.58 
 
 
507 aa  523  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  53.7 
 
 
512 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  54.21 
 
 
523 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  51.25 
 
 
528 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  55.12 
 
 
506 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  50.98 
 
 
513 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  50.98 
 
 
515 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  52.45 
 
 
510 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  52.26 
 
 
507 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  52.8 
 
 
520 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  50.98 
 
 
513 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  51.57 
 
 
512 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  52.88 
 
 
524 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  52.53 
 
 
522 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  53.44 
 
 
525 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  50.78 
 
 
513 aa  521  1e-146  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  53.2 
 
 
518 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  54.17 
 
 
534 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  53.28 
 
 
523 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  52.28 
 
 
527 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.6 
 
 
575 aa  521  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  52.68 
 
 
522 aa  518  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  51.66 
 
 
510 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  52.7 
 
 
525 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.91 
 
 
542 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  51.06 
 
 
514 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.91 
 
 
542 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  51.16 
 
 
528 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  52.22 
 
 
521 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  50.87 
 
 
524 aa  515  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  50.59 
 
 
513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  50.88 
 
 
511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  52.85 
 
 
501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  50.68 
 
 
517 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  53.09 
 
 
529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  54.07 
 
 
556 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  50.88 
 
 
508 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  51.05 
 
 
526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52 
 
 
533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  50.2 
 
 
517 aa  515  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  53 
 
 
547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  50.87 
 
 
527 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  52.33 
 
 
522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  52.16 
 
 
513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>