More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1937 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  84.45 
 
 		 507 aa  875    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  100 
 
 		 508 aa  1020    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  70.67 
 
 		 505 aa  734    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  56.26 
 
 		 522 aa  555  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  55.99 
 
 		 516 aa  552  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  52.75 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  55.8 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  52.64 
 
 		 513 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  53.24 
 
 		 511 aa  535  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  52.06 
 
 		 517 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  54.42 
 
 		 510 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  50.77 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  54.21 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  50.97 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  53.74 
 
 		 523 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.85 
 
 		 527 aa  529  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  53 
 
 		 528 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  53.53 
 
 		 518 aa  528  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  51.96 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  51.37 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  55.66 
 
 		 518 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  52.05 
 
 		 517 aa  525  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  53.56 
 
 		 522 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  51.67 
 
 		 512 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  52.93 
 
 		 531 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  54.26 
 
 		 534 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  48.92 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  52.98 
 
 		 525 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  51.18 
 
 		 511 aa  525  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  53.99 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  53.21 
 
 		 532 aa  528  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  53.8 
 
 		 517 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  54.49 
 
 		 518 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  51.87 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  51.46 
 
 		 522 aa  521  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  55.08 
 
 		 518 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  53.58 
 
 		 556 aa  525  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  53.73 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  54.1 
 
 		 519 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  55.27 
 
 		 518 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  53.55 
 
 		 525 aa  522  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  52.99 
 
 		 526 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  50.29 
 
 		 507 aa  518  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  52.41 
 
 		 524 aa  518  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  50.97 
 
 		 528 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  53.33 
 
 		 533 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.78 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  53.27 
 
 		 521 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  50.58 
 
 		 528 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  49.61 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  50.98 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  52.02 
 
 		 525 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  53.14 
 
 		 501 aa  518  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  51.57 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  52.22 
 
 		 527 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  52.14 
 
 		 520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  52.46 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  50.29 
 
 		 523 aa  518  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  53.32 
 
 		 517 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  50.67 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  50.67 
 
 		 525 aa  517  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  51.74 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  52.8 
 
 		 520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  51.75 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  52.13 
 
 		 537 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  52.52 
 
 		 575 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  53.71 
 
 		 517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  53.1 
 
 		 533 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  51.16 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  51.57 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  53.33 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  51.18 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  50.39 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  50.78 
 
 		 517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  51.17 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  52.41 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  52.94 
 
 		 501 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  53.42 
 
 		 513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  52.33 
 
 		 534 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  51.55 
 
 		 542 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  53.04 
 
 		 527 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  52.69 
 
 		 547 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  51.55 
 
 		 542 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  51.36 
 
 		 520 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  50.29 
 
 		 513 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  51.54 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  51.65 
 
 		 516 aa  511  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  53.04 
 
 		 527 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  51.16 
 
 		 525 aa  511  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  51.06 
 
 		 542 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  53.77 
 
 		 527 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  50.19 
 
 		 575 aa  512  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  51.84 
 
 		 520 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  51.16 
 
 		 525 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  51.54 
 
 		 523 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  51.25 
 
 		 520 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  50.97 
 
 		 542 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  51.33 
 
 		 526 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  50.38 
 
 		 525 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  51.86 
 
 		 515 aa  510  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>