More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6529 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  74.32 
 
 		 535 aa  764    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  78.82 
 
 		 522 aa  822    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  76.36 
 
 		 520 aa  783    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0910  GMP synthase, large subunit  76.82 
 
 		 519 aa  789    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  75.62 
 
 		 524 aa  774    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  77.56 
 
 		 525 aa  809    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  76.36 
 
 		 517 aa  790    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  68.46 
 
 		 520 aa  730    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  73.75 
 
 		 528 aa  767    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  85.74 
 
 		 514 aa  894    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  77.29 
 
 		 547 aa  806    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  73.1 
 
 		 517 aa  739    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  74.71 
 
 		 523 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  73.86 
 
 		 527 aa  768    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  76.94 
 
 		 523 aa  788    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  74.95 
 
 		 526 aa  774    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  74.47 
 
 		 534 aa  769    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  76.25 
 
 		 526 aa  776    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  75.39 
 
 		 523 aa  747    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  63.01 
 
 		 516 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  70.54 
 
 		 556 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  74.57 
 
 		 539 aa  766    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  77.16 
 
 		 533 aa  790    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  73.46 
 
 		 533 aa  768    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  73.04 
 
 		 529 aa  755    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  100 
 
 		 519 aa  1040    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  76.55 
 
 		 515 aa  780    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  79.54 
 
 		 519 aa  818    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  79.54 
 
 		 519 aa  818    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  73.8 
 
 		 529 aa  761    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  68.47 
 
 		 520 aa  731    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  70.55 
 
 		 522 aa  730    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  75.14 
 
 		 527 aa  774    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  79.54 
 
 		 519 aa  818    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  79.96 
 
 		 522 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  72.73 
 
 		 534 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  72.8 
 
 		 527 aa  747    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  76.74 
 
 		 517 aa  795    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  74.85 
 
 		 516 aa  782    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  63.41 
 
 		 506 aa  624  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  60.53 
 
 		 517 aa  621  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  59.49 
 
 		 510 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  60.94 
 
 		 533 aa  610  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  60.47 
 
 		 513 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  57.59 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  57.53 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  55.62 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  56.64 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  56.84 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  55.19 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  56.16 
 
 		 512 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.03 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  56.16 
 
 		 509 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  54.99 
 
 		 515 aa  588  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  54.99 
 
 		 515 aa  588  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  54.99 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  54.79 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  55.97 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  54.99 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  54.6 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  54.6 
 
 		 512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  54.79 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  54.4 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  53.23 
 
 		 517 aa  578  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.3 
 
 		 510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  54.01 
 
 		 512 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  55.49 
 
 		 528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  54.88 
 
 		 575 aa  571  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  53.23 
 
 		 517 aa  574  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  55.92 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  56.5 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  58.19 
 
 		 518 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.68 
 
 		 511 aa  570  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  54.08 
 
 		 537 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  56.15 
 
 		 528 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  54.91 
 
 		 540 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  55.58 
 
 		 528 aa  566  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  53.54 
 
 		 575 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  53.09 
 
 		 517 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  54.27 
 
 		 528 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  53.92 
 
 		 542 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  53.59 
 
 		 511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  53.89 
 
 		 528 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  58.38 
 
 		 518 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  58.57 
 
 		 518 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  53.92 
 
 		 542 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  53.08 
 
 		 528 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  57.93 
 
 		 510 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  53.86 
 
 		 516 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  58.57 
 
 		 518 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  52.05 
 
 		 513 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  52.05 
 
 		 513 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  54.1 
 
 		 507 aa  558  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  53.86 
 
 		 516 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  52.79 
 
 		 533 aa  557  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  52.93 
 
 		 508 aa  558  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  54.95 
 
 		 515 aa  556  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  53.73 
 
 		 540 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  53.74 
 
 		 531 aa  556  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  56.56 
 
 		 513 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>