More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2764 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  60.93 
 
 		 525 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  60.93 
 
 		 525 aa  648    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1072  GMP synthase  65.61 
 
 		 525 aa  691    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  62.34 
 
 		 520 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1032  GMP synthase  65.42 
 
 		 525 aa  689    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  66.3 
 
 		 525 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2402  GMP synthase  79.78 
 
 		 539 aa  865    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.630699  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  67.29 
 
 		 524 aa  714    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1431  GMP synthase  79.78 
 
 		 547 aa  875    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00571837  normal  0.0960661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  60.93 
 
 		 525 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  88.31 
 
 		 538 aa  971    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  59.81 
 
 		 525 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  61.34 
 
 		 525 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  59.89 
 
 		 525 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1450  GMP synthase  66.17 
 
 		 525 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0677657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  60.93 
 
 		 525 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  76.16 
 
 		 527 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  61.52 
 
 		 517 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  60.75 
 
 		 525 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1522  GMP synthase  79.78 
 
 		 539 aa  865    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.403543  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  61.48 
 
 		 525 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  61.48 
 
 		 525 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1262  GMP synthase  66.36 
 
 		 525 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  59.55 
 
 		 536 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2337  GMP synthase  73.87 
 
 		 544 aa  795    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  63.2 
 
 		 525 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  88.68 
 
 		 538 aa  976    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1854  GMP synthase  79.23 
 
 		 539 aa  852    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  73.56 
 
 		 520 aa  780    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  75.79 
 
 		 527 aa  819    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1308  GMP synthase  79.78 
 
 		 539 aa  856    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00743911  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2546  GMP synthase  79.6 
 
 		 547 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0614  GMP synthase  64.67 
 
 		 524 aa  675    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4587  GMP synthase  65.61 
 
 		 525 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  80.51 
 
 		 539 aa  881    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  61.31 
 
 		 525 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5299  GMP synthase  78.69 
 
 		 539 aa  846    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1622  GMP synthase  84.17 
 
 		 534 aa  924    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661733  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2021  GMP synthase  79.78 
 
 		 539 aa  865    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  88.7 
 
 		 540 aa  982    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1030  GMP synthase  65.42 
 
 		 525 aa  690    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  61.31 
 
 		 525 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  60.75 
 
 		 525 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1615  GMP synthase  65.61 
 
 		 526 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.25634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  60.75 
 
 		 525 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  61.5 
 
 		 525 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  74.4 
 
 		 521 aa  797    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  60.45 
 
 		 525 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  67.9 
 
 		 522 aa  736    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  59.37 
 
 		 525 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  65.42 
 
 		 527 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2058  GMP synthase  79.96 
 
 		 599 aa  870    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  80.71 
 
 		 532 aa  866    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  90.02 
 
 		 541 aa  990    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  65.61 
 
 		 525 aa  696    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  61.12 
 
 		 525 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1292  GMP synthase  79.78 
 
 		 539 aa  865    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2287  GMP synthase  84.73 
 
 		 536 aa  891    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  63.27 
 
 		 542 aa  685    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  90.17 
 
 		 540 aa  988    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  73.93 
 
 		 526 aa  787    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  89.05 
 
 		 539 aa  987    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  76.35 
 
 		 527 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  60.45 
 
 		 525 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  60.93 
 
 		 525 aa  648    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  65.86 
 
 		 525 aa  697    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  61.12 
 
 		 517 aa  649    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0016  GMP synthase  59.37 
 
 		 531 aa  635    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0584814  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1463  GMP synthase  78.51 
 
 		 539 aa  845    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160024  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  60.93 
 
 		 525 aa  648    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2454  GMP synthase  79.78 
 
 		 539 aa  865    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  61.31 
 
 		 525 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0530  GMP synthase  75.23 
 
 		 535 aa  816    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  61.9 
 
 		 517 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6088  GMP synthase  78.87 
 
 		 539 aa  850    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1422  GMP synthase  75.23 
 
 		 535 aa  819    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  60.97 
 
 		 525 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  60.85 
 
 		 525 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  60.63 
 
 		 525 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1681  GMP synthase  62.24 
 
 		 529 aa  671    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  87.38 
 
 		 539 aa  976    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  60.67 
 
 		 523 aa  646    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  68.6 
 
 		 523 aa  722    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  59.7 
 
 		 525 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  65.79 
 
 		 526 aa  686    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  63.74 
 
 		 525 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2764  GMP synthase  100 
 
 		 539 aa  1102    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2009  GMP synthase  78.87 
 
 		 539 aa  850    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  65.61 
 
 		 525 aa  688    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2022  GMP synthase  78.87 
 
 		 539 aa  848    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  65.23 
 
 		 525 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3290  GMP synthase  79.78 
 
 		 539 aa  865    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0624455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  61.12 
 
 		 525 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  59.93 
 
 		 521 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  60.11 
 
 		 532 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1989  GMP synthase  78.87 
 
 		 539 aa  850    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314253  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1891  GMP synthase  78.87 
 
 		 539 aa  848    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.888833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  61.31 
 
 		 525 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  59.7 
 
 		 525 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  60.93 
 
 		 525 aa  648    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>